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zhangjie2005

木虫 (小有名气)

[求助] 大分子蛋白的原核表达 已有1人参与

本人初涉蛋白表达领域,要做的蛋白分子较大,有900个氨基酸,看文献中是先做一下蛋白可溶性分析和免疫原性分析,然后再做部分片段的原核表达。想请问一下应该怎么做这两种分析?用什么软件?跪谢!
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蛋白表达纯化与检测

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恶魔的左眼

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangjie2005: 金币+5, 有帮助 2015-05-20 17:33:34
蛋白的可溶性分析通常是用SDS-PAGE来做,具体操作如下:
诱导表达后,12000 rpm离心1 min收获菌体,50 mL菌液沉淀用5 mL结合缓冲液重悬,经超声波充分破碎后离心,沉淀重悬于1/10 体积的结合缓冲液中,分别取上清及沉淀进行电泳分析。取1.5ml诱导后的菌液,离心后将菌体重悬于100 ul Buffer A中,冰浴30分钟。离心收集菌体,上清即为周质蛋白部分,沉淀重悬于0.1mol/L Tris-HCl(PH8.0)溶液中,冻融破碎细胞,离心,上清为胞质部分,沉淀部分为不溶性包涵体和细胞膜组分。将各组分加入SDS-PAGE样品缓冲液,进行SDS-PAGE分析。
结合缓冲液: 0.5 mol/LNaCl,20 mmol/L Tris•Cl,2 mmol/L ZnCl2,5 mmol/L咪唑,PH7.5
Buffer A: 1mg/ml 溶菌酶、20% 蔗糖、30 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,PH8.0.
注意大分子蛋白表达时很容易降解

免疫原性检测可以用Western Blot来做
早上一副睡不醒的样子,下午一副没睡醒的样子,晚上一副打了鸡血的样子!
2楼2015-05-20 11:40:50
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zhangjie2005

木虫 (小有名气)

谢谢您的回复!我现在的问题是蛋白分子太大,不好做全长表达,所以想只表达其中一部分片段,这个选择要有个依据,该怎么选?有没有软件可以预测蛋白分子的可溶性和免疫原性,也就是说预测一下看抗原决定簇在哪部分?多谢!
3楼2015-05-20 17:32:39
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恶魔的左眼

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangjie2005 at 2015-05-20 17:32:39
谢谢您的回复!我现在的问题是蛋白分子太大,不好做全长表达,所以想只表达其中一部分片段,这个选择要有个依据,该怎么选?有没有软件可以预测蛋白分子的可溶性和免疫原性,也就是说预测一下看抗原决定簇在哪部分? ...

嗯,因为我主要从事的是蛋白表达的下游实验部分,所以对上游的分析做的比较少,我找同事问了一下,他们给我一个网址,你可以到上面对你的蛋白进行一下测试。祝你成功
http://mips.helmholtz-muenchen.de/proso/proso.seam

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早上一副睡不醒的样子,下午一副没睡醒的样子,晚上一副打了鸡血的样子!
4楼2015-05-21 09:18:31
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zhangjie2005

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 恶魔的左眼 at 2015-05-21 09:18:31
嗯,因为我主要从事的是蛋白表达的下游实验部分,所以对上游的分析做的比较少,我找同事问了一下,他们给我一个网址,你可以到上面对你的蛋白进行一下测试。祝你成功
http://mips.helmholtz-muenchen.de/proso/pr ...

这个网站很好,非常感谢!
5楼2015-05-21 20:00:17
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