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dr西小瓜

新虫 (初入文坛)

[求助] 提DNA纯度要么徘徊在1.5要么大于2,甚至到5点几,求助! 已有4人参与

各位大神,小白现在提大肠杆菌DNA准备跑PCR的,用TAKARA DNAiso reagent,用无水乙醇后都看不到沉淀的,提了3次,10管只有一管是A260/280浮动在1.8的。我想问下——    1,百度到的对提DNA的纯度要求不一样 ,到底1.6-1.8还是1.8-2.0较好?我跑pcr的是不是不用对纯度要求那么严格?那也得有个度吧?大概多少?
             2,有谁做过类似的吗?没沉淀是因为我提的不好吗?
             3,我测纯度的时候,同一样品相差很大,舍友说因为我没混匀。我是那样想的,前面1ml枪头都要剪去2-3mm以减小剪切力对DNA的伤害,我就不敢用小枪头混匀了……怎么办啊?
             4,我要不要来个煮沸法对照一下下?煮沸法我看到大家的做法也不太一样,有谁用煮沸法提过大肠杆菌的DNA吗?我要提的大概是1KB 。
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WHABnew

新虫 (小有名气)

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5楼: Originally posted by dr西小瓜 at 2015-05-04 18:58:59
仪器是NANO2000...

好像学校用的都是这个,建议你一个样品多测两次,也算排除一个因素嘛,还有就是其实如果普通PCR对DAN纯度要求没那么高,如果还要做其他实验就不知道了
10楼2015-05-06 17:23:45
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WHABnew

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-05-05 22:45:26
建议你看下测浓度的仪器,以前我们做反转测RNA浓度,测四五次浓度都不一样差别还很大,以至于最后就直接测一次算了。
2楼2015-05-04 14:32:00
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

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【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-05-05 22:45:45
A260/280在1.8-2.0之间是纯度较好,高于或低于这个数字可能有酚或RNA等污染。混匀很重要,可以采用轻柔的方式混匀。祝顺利
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
3楼2015-05-04 16:58:31
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aofeng860308

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-05-05 22:46:05
比值是1.8-2.0比较好。如果实验目的是做PCR的话,建议不用抽提基因组,直接用菌液做模板即可。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2015-05-04 18:14:24
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dr西小瓜

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by WHABnew at 2015-05-04 14:32:00
建议你看下测浓度的仪器,以前我们做反转测RNA浓度,测四五次浓度都不一样差别还很大,以至于最后就直接测一次算了。

仪器是NANO2000
5楼2015-05-04 18:58:59
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dr西小瓜

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wangranjun at 2015-05-04 16:58:31
A260/280在1.8-2.0之间是纯度较好,高于或低于这个数字可能有酚或RNA等污染。混匀很重要,可以采用轻柔的方式混匀。祝顺利

用小枪头搅拌而不是吹打是吗?
6楼2015-05-04 21:40:41
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dr西小瓜

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by aofeng860308 at 2015-05-04 18:14:24
比值是1.8-2.0比较好。如果实验目的是做PCR的话,建议不用抽提基因组,直接用菌液做模板即可。

用菌液的量会不会很难把握?
7楼2015-05-04 21:42:21
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

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引用回帖:
6楼: Originally posted by dr西小瓜 at 2015-05-04 21:40:41
用小枪头搅拌而不是吹打是吗?...

嗯,是的,吹打很容易剪切断……
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
8楼2015-05-04 22:26:19
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aofeng860308

木虫 (正式写手)

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引用回帖:
7楼: Originally posted by dr西小瓜 at 2015-05-04 21:42:21
用菌液的量会不会很难把握?...

你要是扩基因,用枪头蘸点菌液就可以了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
9楼2015-05-04 23:00:37
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