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混合配搭

新虫 (小有名气)

[交流] 基因家族的问题

有一段序列，想找它的基因家族，是所有序列都有家族吗？家族有多大，和选几个可以自己决定吗？我的序列是核苷酸，BLAST后没出现几个，我转成了氨基酸后有一些，我就把这些与它同源性高的氨基酸序列都下载下来，就可以建一个家族了吗？还需要用什么软件筛选吗？希望大家帮帮我，这方面不懂啊
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1楼 2015-04-15 08:05:17
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混合配搭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hailunl at 2015-04-15 15:56:27
如果想找基因家族，最好用氨基酸序列比对。
基因家族大小不确定，小的只有几个，大的家族比如Mbp几百个都有可能。
先查找序列，最后功能域分析，确定是否是自己基因家族成员。

功能域分析会直接给出是否是一个家族吗？

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8楼2015-04-15 22:32:49
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阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)
路过的看了一下，帮顶，祝福好运！~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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自强不息，厚德载物；独立精神，自由思想。
4楼2015-04-15 08:33:24
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hailunl

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-15 22:08:06
混合配搭: 金币+1 2015-04-15 22:31:05
如果想找基因家族，最好用氨基酸序列比对。
基因家族大小不确定，小的只有几个，大的家族比如Mbp几百个都有可能。
先查找序列，最后功能域分析，确定是否是自己基因家族成员。
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6楼2015-04-15 15:56:27
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混合配搭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hailunl at 2015-04-15 15:56:27
如果想找基因家族，最好用氨基酸序列比对。
基因家族大小不确定，小的只有几个，大的家族比如Mbp几百个都有可能。
先查找序列，最后功能域分析，确定是否是自己基因家族成员。

功能域分析怎么看啊？网站会直接给出吗？他会有几个排名是吗？具体怎么选择啊？不太懂，希望说的仔细一点呗。

[ 发自小木虫客户端 ]
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7楼2015-04-15 22:30:58
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