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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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混合配搭

新虫 (小有名气)

[交流] 基因家族的问题

有一段序列,想找它的基因家族,是所有序列都有家族吗?家族有多大,和选几个可以自己决定吗?我的序列是核苷酸,BLAST后没出现几个,我转成了氨基酸后有一些,我就把这些与它同源性高的氨基酸序列都下载下来,就可以建一个家族了吗?还需要用什么软件筛选吗?希望大家帮帮我,这方面不懂啊
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hailunl

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-15 22:08:06
混合配搭: 金币+1 2015-04-15 22:31:05
如果想找基因家族,最好用氨基酸序列比对。
基因家族大小不确定,小的只有几个,大的家族比如Mbp几百个都有可能。
先查找序列,最后功能域分析,确定是否是自己基因家族成员。
6楼2015-04-15 15:56:27
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阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)

路过的看了一下,帮顶,祝福好运!~~~~~~~~~~~~~~~~~~
自强不息,厚德载物;独立精神,自由思想。
4楼2015-04-15 08:33:24
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混合配搭

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hailunl at 2015-04-15 15:56:27
如果想找基因家族,最好用氨基酸序列比对。
基因家族大小不确定,小的只有几个,大的家族比如Mbp几百个都有可能。
先查找序列,最后功能域分析,确定是否是自己基因家族成员。

功能域分析怎么看啊?网站会直接给出吗?他会有几个排名是吗?具体怎么选择啊?不太懂,希望说的仔细一点呗。

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-04-15 22:30:58
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混合配搭

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hailunl at 2015-04-15 15:56:27
如果想找基因家族,最好用氨基酸序列比对。
基因家族大小不确定,小的只有几个,大的家族比如Mbp几百个都有可能。
先查找序列,最后功能域分析,确定是否是自己基因家族成员。

功能域分析会直接给出是否是一个家族吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2015-04-15 22:32:49
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