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等灰灰

银虫 (小有名气)

[求助] 如何查询某种疾病的基因序列

前辈们是怎样查询某个未知疾病的基因序列的呢?
在CIBN上弄了半天,一副弄不明白的样子。
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下雨没有伞

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-16 20:48:21
等灰灰: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-09-17 14:08:08
基因序列的查询应该有一个目的性的东西吧。
比如耳聋基因、BCR基因等。
你的未知疾病是一个什么疾病呢?如果什么都没有那没有办法查。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
在这个网址里查
只有向往美好的生活,才能过上美好的生活
2楼2013-09-16 17:48:50
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1.首先明确某基因和某疾病的关系。大多数疾病都是非单基因突变引起的。2.NCBI的基因数据有该基因的功能,有些和疾病相关。3.“未知疾病的基因”是 “未知疾病”还是“未知基因‘?未知是没有研究,还是数据库中有还没查?
3楼2013-09-17 13:44:49
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等灰灰

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 下雨没有伞 at 2013-09-16 17:48:50
基因序列的查询应该有一个目的性的东西吧。
比如耳聋基因、BCR基因等。
你的未知疾病是一个什么疾病呢?如果什么都没有那没有办法查。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
在这个网址里查

谢谢你的回复。
因为我是刚刚接触这方面的内容,所以问题提的冒昧了。
我的目的就是先确定一种目的疾病,而这种疾病是由基因突变引起的,我想知道这段基因序列,进而对其研究。

谢谢你提供的网址了呢,现在的问题是我不太会细化搜索。
比如我搜索Lung Cancer,就会出来一堆基因编号(对这个网址陌生的厉害,各种尝试中。。。),就不知道特征序列怎么选择了。

ps:我课题是分子诊断方面的,刚接触,前辈有什么入门建议么?不甚感激。
4楼2013-09-17 14:07:55
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等灰灰

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-09-17 13:44:49
1.首先明确某基因和某疾病的关系。大多数疾病都是非单基因突变引起的。2.NCBI的基因数据有该基因的功能,有些和疾病相关。3.“未知疾病的基因”是 “未知疾病”还是“未知基因‘?未知是没有研究,还是数据库中有还 ...

谢谢前辈指导~
因为我刚接触分子诊断这一块,想找一个与疾病相关的基因进行研究,目的疾病和目的基因都没有确定下来。
对查询引起疾病的基因序列很是门外汉,还希望前辈指导。
5楼2013-09-17 14:12:20
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hl16010921

木虫 (正式写手)

1。楼主需要检索的是某疾病的标志性基因
2.这基因不一定和该病有直接因果关系,但要有明确的相关性。
3.建议从癌症和肿瘤细胞入手好些,一方面细胞的表面标志物研究成熟,另一方面细胞好养。
4.http://omim.org/你试试,上面有基因的细胞株表达和相关疾病。前提是你确定基因。
5.从基因到疾病是可查的,但从疾病到基因,我现在没啥好办法,所有的数据库对哪些疾病的标志基因都没有全面的数据(临床统计有少量的肿瘤基因)
因此先要确定1疾病,2看文献,3找病变组织和正常组织的表达差异(高通量筛选),4然后才能确定基因。如果没条件可以跳过3,通过大规模查文献确定检测基因。

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6楼2013-09-17 14:46:02
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等灰灰

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-09-17 14:46:02
1。楼主需要检索的是某疾病的标志性基因
2.这基因不一定和该病有直接因果关系,但要有明确的相关性。
3.建议从癌症和肿瘤细胞入手好些,一方面细胞的表面标志物研究成熟,另一方面细胞好养。
4.http://omim.org/ ...

很是感谢你的建议呢。
我下载了一堆相关的文献,还从知网上下了一堆博士论文,准备找点灵感。
打算从肺癌入手。
再次感谢啦
7楼2013-09-17 15:02:51
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shaoliwei00

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 等灰灰 at 2013-09-17 15:02:51
很是感谢你的建议呢。
我下载了一堆相关的文献,还从知网上下了一堆博士论文,准备找点灵感。
打算从肺癌入手。
再次感谢啦...

楼主,我现在也有相似的困难,不知道你现在怎么样了?我老师让我找一些基因的上下游,以及他们与哪些疾病有关,我也无法入手,麻烦你给些建议吧?真心感谢!
每天努力一点点,进步一点点
8楼2014-03-07 00:39:25
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