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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何查询某种疾病的基因序列
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等灰灰

银虫 (小有名气)

[求助] 如何查询某种疾病的基因序列

前辈们是怎样查询某个未知疾病的基因序列的呢？
在CIBN上弄了半天，一副弄不明白的样子。
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1楼2013-09-16 17:22:59
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hl16010921

木虫 (正式写手)
1。楼主需要检索的是某疾病的标志性基因
2.这基因不一定和该病有直接因果关系，但要有明确的相关性。
3.建议从癌症和肿瘤细胞入手好些，一方面细胞的表面标志物研究成熟，另一方面细胞好养。
4.http://omim.org/你试试，上面有基因的细胞株表达和相关疾病。前提是你确定基因。
5.从基因到疾病是可查的，但从疾病到基因，我现在没啥好办法，所有的数据库对哪些疾病的标志基因都没有全面的数据（临床统计有少量的肿瘤基因）
因此先要确定1疾病，2看文献，3找病变组织和正常组织的表达差异（高通量筛选），4然后才能确定基因。如果没条件可以跳过3，通过大规模查文献确定检测基因。
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等灰灰
6楼2013-09-17 14:46:02
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下雨没有伞

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-16 20:48:21
等灰灰: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-09-17 14:08:08
基因序列的查询应该有一个目的性的东西吧。
比如耳聋基因、BCR基因等。
你的未知疾病是一个什么疾病呢？如果什么都没有那没有办法查。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
在这个网址里查
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只有向往美好的生活，才能过上美好的生活
2楼2013-09-16 17:48:50
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1.首先明确某基因和某疾病的关系。大多数疾病都是非单基因突变引起的。2.NCBI的基因数据有该基因的功能，有些和疾病相关。3.“未知疾病的基因”是 “未知疾病”还是“未知基因‘？未知是没有研究，还是数据库中有还没查？
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3楼2013-09-17 13:44:49
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等灰灰

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 下雨没有伞 at 2013-09-16 17:48:50
基因序列的查询应该有一个目的性的东西吧。
比如耳聋基因、BCR基因等。
你的未知疾病是一个什么疾病呢？如果什么都没有那没有办法查。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
在这个网址里查

谢谢你的回复。
因为我是刚刚接触这方面的内容，所以问题提的冒昧了。
我的目的就是先确定一种目的疾病，而这种疾病是由基因突变引起的，我想知道这段基因序列，进而对其研究。

谢谢你提供的网址了呢，现在的问题是我不太会细化搜索。
比如我搜索Lung Cancer，就会出来一堆基因编号(对这个网址陌生的厉害，各种尝试中。。。)，就不知道特征序列怎么选择了。

ps：我课题是分子诊断方面的，刚接触，前辈有什么入门建议么？不甚感激。
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4楼2013-09-17 14:07:55
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