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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助氨基酸序列比对结果分析
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破冰的种子

新虫 (小有名气)

[求助] 求助氨基酸序列比对结果分析 已有1人参与

最近遇到关于blast的结果分析问题，实在无从着手，请各位大侠帮忙指教，非常感谢！
下面图中Subject是我自己的序列，Query放了标准序列，比对后的加号、减号和星号（*）分别是什么意思？还有上下都有氨基酸，但是中间是空格的或者是有加号的都是什么意思？真是一点都看不懂啊……
这些说明氨基酸序列发生了哪种类型的突变呢？

求助氨基酸序列比对结果分析
1.PNG
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1楼 2015-03-27 15:54:34
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growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
破冰的种子: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-03-28 13:56:40
你做的blast2seq？一般query才是你自己的序列啊。

blast结果中，中间一排表示query序列和subject序列的关系，“+”表示类似氨基酸，空格表示不同源氨基酸。氨基酸序列中，“-”表示该序列跟对比的序列相比出现了gap，“*”当然是表示原序列中有终止密码子了。
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2楼2015-03-28 10:38:28
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破冰的种子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by growlywolf at 2015-03-28 10:38:28
你做的blast2seq？一般query才是你自己的序列啊。

blast结果中，中间一排表示query序列和subject序列的关系，“+”表示类似氨基酸，空格表示不同源氨基酸。氨基酸序列中，“-”表示该序列跟对比的序列相比出现了 ...

是的，做的两条序列的blast。非常感谢您的帮助，好人呐~
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3楼2015-03-28 13:56:22
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破冰的种子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by growlywolf at 2015-03-28 10:38:28
你做的blast2seq？一般query才是你自己的序列啊。

blast结果中，中间一排表示query序列和subject序列的关系，“+”表示类似氨基酸，空格表示不同源氨基酸。氨基酸序列中，“-”表示该序列跟对比的序列相比出现了 ...

不好意思我再问一下，这些加号减号空格的变化会不会导致蛋白质功能的改变？
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4楼2015-03-28 14:14:34
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growlywolf

金虫 (小有名气)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-29 23:13:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by 破冰的种子 at 2015-03-28 14:14:34
不好意思我再问一下，这些加号减号空格的变化会不会导致蛋白质功能的改变？...

这些信息只表示你的序列和参考序列之间的差异，至于会不会导致功能变化，要根据具体的实验证据分析。
当然，如果这些差异确实出现在一些关键的位点，那么确实有可能导致功能变化。
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5楼2015-03-28 17:40:04
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颜紫星

新虫 (著名写手)
我最近在学氨基酸多序列的比对，不知道哪位大神就上面那副图可以详细描述一下，万分感谢

发自小木虫Android客户端
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6楼2017-05-03 23:17:02
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