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破冰的种子

新虫 (小有名气)

[求助] 求助氨基酸序列比对结果分析 已有1人参与

最近遇到关于blast的结果分析问题,实在无从着手,请各位大侠帮忙指教,非常感谢!
下面图中Subject是我自己的序列,Query放了标准序列,比对后的加号、减号和星号(*)分别是什么意思?还有上下都有氨基酸,但是中间是空格的或者是有加号的都是什么意思?真是一点都看不懂啊……
这些说明氨基酸序列发生了哪种类型的突变呢?

求助氨基酸序列比对结果分析
1.PNG
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growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
破冰的种子: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-03-28 13:56:40
你做的blast2seq?一般query才是你自己的序列啊。

blast结果中,中间一排表示query序列和subject序列的关系,“+”表示类似氨基酸,空格表示不同源氨基酸。氨基酸序列中,“-”表示该序列跟对比的序列相比出现了gap,“*”当然是表示原序列中有终止密码子了。
2楼2015-03-28 10:38:28
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破冰的种子

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by growlywolf at 2015-03-28 10:38:28
你做的blast2seq?一般query才是你自己的序列啊。

blast结果中,中间一排表示query序列和subject序列的关系,“+”表示类似氨基酸,空格表示不同源氨基酸。氨基酸序列中,“-”表示该序列跟对比的序列相比出现了 ...

是的,做的两条序列的blast。非常感谢您的帮助,好人呐~
3楼2015-03-28 13:56:22
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破冰的种子

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by growlywolf at 2015-03-28 10:38:28
你做的blast2seq?一般query才是你自己的序列啊。

blast结果中,中间一排表示query序列和subject序列的关系,“+”表示类似氨基酸,空格表示不同源氨基酸。氨基酸序列中,“-”表示该序列跟对比的序列相比出现了 ...

不好意思我再问一下,这些加号减号空格的变化会不会导致蛋白质功能的改变?
4楼2015-03-28 14:14:34
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growlywolf

金虫 (小有名气)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-29 23:13:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by 破冰的种子 at 2015-03-28 14:14:34
不好意思我再问一下,这些加号减号空格的变化会不会导致蛋白质功能的改变?...

这些信息只表示你的序列和参考序列之间的差异,至于会不会导致功能变化,要根据具体的实验证据分析。
当然,如果这些差异确实出现在一些关键的位点,那么确实有可能导致功能变化。
5楼2015-03-28 17:40:04
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颜紫星

新虫 (著名写手)

我最近在学氨基酸多序列的比对,不知道哪位大神就上面那副图可以详细描述一下,万分感谢

发自小木虫Android客户端
6楼2017-05-03 23:17:02
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