应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于序列比对
61/1返回列表
查看: 1503  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

love_st

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】关于序列比对 已有4人参与

一直有个疑问就是，每次设计引物探针的时候由于型别或者突变较大，而需要在NCBI上面下载较多的序列，然后比对，麻烦的是要把每条序列都分别放在一个tet文件里，然后去做多序列比对,是否有这样的软件，能够把我从NCBI成批下载下来的序列也就是说在同一个文档里，直接进行比对，这样就省略了很多时间的啊？！有这样的软件么？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-07-23 17:31:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★ ★
看天(金币+3):鼓励交流和分享 2010-07-23 18:33:27
love_st(金币+5):bioedit软件我下载了，似乎功能蛮强大的，谢谢 2010-07-26 12:48:48
LZ一般用什么软件比对的啊？
我一般用bioedit就行了啊，不过，你从NCBI上面下载的时候，一定要是fasta格式的，可以直接比对啊，上次我从NCBI上批量下载了1800多个ITS序列，直接就比对了……一定是fasta格式的啊，我用的bioedit软件，别的应该也可以，不太清楚……
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-07-23 18:03:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Atalpha

木虫 (著名写手)
love_st(金币+1): 2010-07-26 12:48:05
SECentral软件就可以
赞一下 回复此楼
3楼2010-07-23 18:19:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

darwinxie

铁杆木虫 (职业作家)

自强瓜族族长-----呆瓜大叔
love_st(金币+1): 2010-07-26 12:48:10
这样的软件很多啊，比对序列的，可以去生物秀下载，呵呵呵
赞一下 回复此楼
一切都会好的，雨后的天空更加明朗！人生苦短，快乐至上，加油！
4楼2010-07-23 18:32:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欣晴5832

金虫 (小有名气)
love_st(金币+5):看来我还是比较笨的一直用dnaman 还用的不亦乐乎 2010-07-26 12:47:58
DNASTAR就可以呀，你直接把你的序列打开并全选，连网blast，就可以从ncbi中搜到好多序列，直接下载后，在DNASTAR软件包中打开megalign程序，将所比对序列直接add进去比对即可，很方便，都不用转换格式。
赞一下 回复此楼
5楼2010-07-26 11:41:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxy337

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
733215楼: Originally posted by love_st at 2010-07-23 17:31:29
一直有个疑问就是，每次设计引物探针的时候由于型别或者突变较大，而需要在NCBI上面下载较多的序列，然后比对，麻烦的是要把每条序列都分别放在一个tet文件里，然后去做多序列比对,是否有这样的软件，能够把我从NCB ...

同学你好，我想请教一下用bioedit怎么记性多序列比对呀？？很急，麻烦帮帮忙吧~
赞一下 回复此楼
6楼2012-12-26 20:45:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 love_st 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭