24小时热门版块排行榜    

查看: 1672  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

love_st

金虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】关于序列比对 已有4人参与

一直有个疑问就是,每次设计引物探针的时候由于型别或者突变较大,而需要在NCBI上面下载较多的序列,然后比对,麻烦的是要把每条序列都分别放在一个tet文件里,然后去做多序列比对,是否有这样的软件,能够把我从NCBI成批下载下来的序列也就是说在同一个文档里,直接进行比对,这样就省略了很多时间的啊?!有这样的软件么?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

darwinxie

铁杆木虫 (职业作家)

自强瓜族族长-----呆瓜大叔

love_st(金币+1): 2010-07-26 12:48:10
这样的软件很多啊,比对序列的,可以去生物秀下载,呵呵呵
一切都会好的,雨后的天空更加明朗!人生苦短,快乐至上,加油!
4楼2010-07-23 18:32:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★ ★ ★
看天(金币+3):鼓励交流和分享 2010-07-23 18:33:27
love_st(金币+5):bioedit软件我下载了,似乎功能蛮强大的,谢谢 2010-07-26 12:48:48
LZ一般用什么软件比对的啊?
我一般用bioedit就行了啊,不过,你从NCBI上面下载的时候,一定要是fasta格式的,可以直接比对啊,上次我从NCBI上批量下载了1800多个ITS序列,直接就比对了……一定是fasta格式的啊,我用的bioedit软件,别的应该也可以,不太清楚……
2楼2010-07-23 18:03:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Atalpha

木虫 (著名写手)

love_st(金币+1): 2010-07-26 12:48:05
SECentral软件就可以
3楼2010-07-23 18:19:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欣晴5832

金虫 (小有名气)

love_st(金币+5):看来我还是比较笨的一直用dnaman 还用的不亦乐乎 2010-07-26 12:47:58
DNASTAR就可以呀,你直接把你的序列打开并全选,连网blast,就可以从ncbi中搜到好多序列,直接下载后,在DNASTAR软件包中打开megalign程序,将所比对序列直接add进去比对即可,很方便,都不用转换格式。
5楼2010-07-26 11:41:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 123/6150 2026-08-19 23:44 by stan_et
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +13 kkkl_v 2026-08-19 13/650 2026-08-19 22:37 by 宝贝虫子
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +12 基诺咪客 2026-08-17 16/800 2026-08-19 22:04 by kk 的小木虫
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见