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love_st

金虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】关于序列比对 已有4人参与

一直有个疑问就是,每次设计引物探针的时候由于型别或者突变较大,而需要在NCBI上面下载较多的序列,然后比对,麻烦的是要把每条序列都分别放在一个tet文件里,然后去做多序列比对,是否有这样的软件,能够把我从NCBI成批下载下来的序列也就是说在同一个文档里,直接进行比对,这样就省略了很多时间的啊?!有这样的软件么?
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wxy337

新虫 (初入文坛)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
733215楼: Originally posted by love_st at 2010-07-23 17:31:29
一直有个疑问就是,每次设计引物探针的时候由于型别或者突变较大,而需要在NCBI上面下载较多的序列,然后比对,麻烦的是要把每条序列都分别放在一个tet文件里,然后去做多序列比对,是否有这样的软件,能够把我从NCB ...

同学你好,我想请教一下用bioedit怎么记性多序列比对呀??很急,麻烦帮帮忙吧~
6楼2012-12-26 20:45:34
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★ ★ ★
看天(金币+3):鼓励交流和分享 2010-07-23 18:33:27
love_st(金币+5):bioedit软件我下载了,似乎功能蛮强大的,谢谢 2010-07-26 12:48:48
LZ一般用什么软件比对的啊?
我一般用bioedit就行了啊,不过,你从NCBI上面下载的时候,一定要是fasta格式的,可以直接比对啊,上次我从NCBI上批量下载了1800多个ITS序列,直接就比对了……一定是fasta格式的啊,我用的bioedit软件,别的应该也可以,不太清楚……
2楼2010-07-23 18:03:11
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Atalpha

木虫 (著名写手)

love_st(金币+1): 2010-07-26 12:48:05
SECentral软件就可以
3楼2010-07-23 18:19:12
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darwinxie

铁杆木虫 (职业作家)

自强瓜族族长-----呆瓜大叔

love_st(金币+1): 2010-07-26 12:48:10
这样的软件很多啊,比对序列的,可以去生物秀下载,呵呵呵
一切都会好的,雨后的天空更加明朗!人生苦短,快乐至上,加油!
4楼2010-07-23 18:32:02
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