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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请问这个3端RACE测序结果表明3端全了吗
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qaz139687

新虫 (小有名气)

[求助] 请问这个3端RACE测序结果表明3端全了吗 已有1人参与

后面好多个AAAAAA，是不是全了？
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    • 2015-01-30 22:59:32, 257.72 K

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1楼 2015-01-30 22:59:49
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
出现polyA了，可以认为已经全了

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2015-01-31 02:24:00
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qaz139687

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ptttmt at 2015-01-31 02:24:00
出现polyA了，可以认为已经全了

但是AAAAAAAAA前面没有aataaa呀
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3楼2015-01-31 14:45:19
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
qaz139687: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-02-01 11:21:04
引用回帖:
3楼: Originally posted by qaz139687 at 2015-01-31 14:45:19
但是AAAAAAAAA前面没有aataaa呀...

polyA加尾信号有很多，AATAAA只是其中之一，并非绝对保守。
例如：
* PAS:AAUAAA and AUUAAA; frequency in human is ~53 and ~17% respectively

** PAS:UAUAAA, AGUAAA, AAGAAA, AAUAUA, AAUACA, CAUAAA, GAUAAA, AAUGAA, UUUAAA, ACUAAA AND AAUAGA; frequency in human is ~23.2%

***PAS:with lowest frequency, may be novel PAS

另外，3-RACE已经能够得出C端氨基酸序列，BLAST结果提示与“章鱼胺受体”具有较高同源性。
结果如图片！
请问这个3端RACE测序结果表明3端全了吗
1.JPG
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4楼2015-01-31 15:51:09
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qaz139687

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ptttmt at 2015-01-31 15:51:09
polyA加尾信号有很多，AATAAA只是其中之一，并非绝对保守。
例如：
* PAS:AAUAAA and AUUAAA; frequency in human is ~53 and ~17% respectively

** PAS:UAUAAA, AGUAAA, AAGAAA, AAUAUA, AAUACA, CAUAAA, GA ...

非常感谢，我的基因就是章鱼胺受体的，开始因为公司给我的 序列里没有那么多个A没注意，后来无意间发现峰图最后有很多A，才怀疑我的是不是全了，经过你这样分析我就有放心了，感谢大神！
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5楼2015-02-01 11:22:43
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andywang6137

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ptttmt at 2015-01-31 15:51:09
polyA加尾信号有很多，AATAAA只是其中之一，并非绝对保守。
例如：
* PAS:AAUAAA and AUUAAA; frequency in human is ~53 and ~17% respectively

** PAS:UAUAAA, AGUAAA, AAGAAA, AAUAUA, AAUACA, CAUAAA, GA ...

你好，请问“* PAS:AAUAAA and AUUAAA; frequency in human is ~53 and ~17% respectively

** PAS:UAUAAA, AGUAAA, AAGAAA, AAUAUA, AAUACA, CAUAAA, GAUAAA, AAUGAA, UUUAAA, ACUAAA AND AAUAGA; frequency in human is ~23.2%

***PAS:with lowest frequency, may be novel PAS” 。这些事来源于那篇文献？谢谢！
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6楼2016-06-29 14:15:02
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