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云高天低

新虫 (初入文坛)

[求助] 自己设计的引物添加了酶切位点之后总是P不出来条带来 已有1人参与

先把自己的序列与设计的引物放上来:
TATCGAGAATGCACCAATGACCGCAATACATGACCGAGTACTAGCTTCTGGTCAATAAGGCATGTGTTAAACAGGGAAAAGAAACACATACTTCCATTCTGAATCACGGGGAGCATCACTTTCTAAAAACTCACTTGGAGCTTCACTGGGTGCTAGTTTTGAGCTTGGAAATACTGGTGATTTGGACGGCCCAGCGTTGCCCCTCGTTACATCACTACTTAAACCTATCTGTTGAGACATTGTAGAAGAGAAGGAACAAATGTACAACCAGATCGTGAACGGATGTCTTGTACGAAGATATTGCGGTAGTATGGAATTGATGCTCTCTACTCACTTGGATATCGAACTTACTTATAGTTGAATAGTCCACGAAGGATGGAGCCCTGAAGAATCATGTCTGATCAAGATAGATCGGAGGTTCCATGGCTTTTGGAATTGAAGCAACGCCACTCACGATATGTACGGTAGATTGTTAGGACAGATTATTGTTAAACCATCTAGAGAATCTTTCTCCTTAGATGTACGATTGGTACGGTGGGCAGGATTGTCATTTGTATTGCGGCACATCTTGATCGTTCCAATCACCACTGAAGTCGACAAAACCCTTGTTGTTTTATCGTTAGGAGATCAAAGACCACTGGTGGACCTTCTATTTTGGTTTTCTGGGGATTTTGTCAATAAGCTCGTTGTCGTTCGGGGTAAATTATGTAAGATGTGAGTAATAAAGTGGGCCGGACTGCCCGAGAATCCACGGACATTGAGGTCTTCACCATGGACAGACTCGAACTAGTATTTTCATATCATCATCATGTACGACAACTCCTTTCATTCTTCACGTACTCGCAATATCATCTTCAATTAATACACTTAACCTTCGGAGATTATTATTCGTGAAAGTTTTAGTCCATTTGCATCGAATCGGCATGAAGCGATCCCCGCCAATCGATTTGTCTCAGGACGGGCGTAAGGAGAAAATAGCTCGTCGACAGGACCCTGTCTCATGCCAGTTTTGTCGGGCCAAGAAACTCAAGGTAAGAATGCCACTCTAAGAAAGATAACGAATCGCTTCTGACTTCAATAGTGTGATCGCAATTTTCCATGCAGTAATTGCAGAGCTCGCAGACTTCCTTGCGTGTCAGCTGCAGGTCAAGCAGACACTCCAGGTTCCCAGCCGATTAATTCTGTCTCGGCAGGATCGTCAAGGTCAGTGCTGCGGCTTCAATGAGTTTTGCTAGCTTTGTCTCATTATTACTATAATAGTCAAGGGATTGAGGAGTTAAACGCCCGTCTGAGAAGGTTAGAGGAACTTCTAGAAAAAAACATCAATGTATCTAGAAGTTCGAGAGATACCGCATCTGGTATTGCTTTTTCCTTGCAACCCTTCTTGTATCAAATCCTGGCTGACAAAAGGCTAGTCGCCTCGACGCAAGAAACGCCTGCAGAAGATGCCCAAATTACAAATACAGTCTCGTGGTTAGAATCTGATGCTTTCGAGCACCGAAACCTCCAAGAGTCCACAAATTATGTAATTCTATTTCCCTAAAACTTAGCTTCGAAGCGCTAATCAAATAGAATCTTCTATGTTACAATGATGAAATCACACAAACTTTTGCTGCTTCCTTTTTAGGTACGTCGGCTACTACTGTACGAACAGGTGTCGACGCTCAAAGTTTGGCTTCACTTCCGTCTAGAAAGCATGCA

下游序列:,正向引物:5’—3’(SacII)AAACCGCGG(酶切位点)TCGTGAACGGATGTCTTG
反向引物5’—3’(KpnI)AAAGGTACC(酶切位点)GGACTCTTGGAGGTTTCG,自己设计的引物,构建载体时作为下游片段用的,正向的引物TM为66.6度。下游为63度。现在P出来的条带完全是弥散的。试过各种方法了,从换体系,梯度PCR到taq酶,所以想换引物了。求大虾帮助设计一下引物,酶切位点还是这两个。不胜感激。
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大海一孤舟

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不知道你要扩那一段区域?
4楼2015-02-07 12:40:06
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查看全部 8 个回答

781055707

木虫 (著名写手)

楼主说下你p的蛋白信息吧.

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
采菊东篱下,悠然见南山。
3楼2015-02-07 00:08:34
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Annamandy

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 云高天低 at 2015-02-06 18:53:06
我知道了已经

我的也是这种情况,加酶切位点后P不出来,请教!
读博好辛苦,坚持住!
5楼2015-10-29 15:55:59
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铿锵爪神

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 云高天低 at 2015-02-06 18:53:06
我知道了已经

楼主分享下经验吧,我也遇到了一样的问题

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-31 17:08:40
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