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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 如何确定是所需引物
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雅瑜1994

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何确定是所需引物 已有2人参与

设计的引物放入oligo7中进行检验，发现PCR分析不错，但是有发夹结构和二聚体（具体结果见截图），这样的引物该不该用呢？如果不用的话，似乎找不到更好的引物。引物的判断标准怎么衡量呢？谢谢回答。

如何确定是所需引物
捕获.PNG
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1楼 2014-12-30 16:59:43
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zl暖暖nn

新虫 (初入文坛)
请问有oligo7安装包吗？求分享，万分感谢
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4楼2016-09-02 21:19:22
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曼舞流苏

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
雅瑜1994(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-08 20:47:17
我觉得有些分析，软件上只是起到借鉴作用，不能盲目听从而否认自己，一个知名文献上面发表了一个目的基因条件和引物序列都很好的，但是在另一个实验室由于各种原因，结果就不一样，真的，这个还要靠自己去摸索的。
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2楼2015-01-08 19:46:05
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翼在天

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
雅瑜1994(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-08 20:47:31
软件分析打分只是告诉你这个引物存在的问题，理论上来说，只要是目的基因上存在的一段序列，拿下来当做引物都可以P出目的条带，只是存在非特异性条带和其他问题。
所以，引物合不合适，一方面是设计，一方面需要你自己通过PCR调整温度和时间以及PCR体系才能得到单一且清晰的目的条带
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3楼2015-01-08 19:55:18
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千里两句

新虫 (小有名气)
从来不用这些软件，直接做

发自小木虫IOS客户端
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5楼2016-09-02 21:30:20
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