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求助关于autodock柔性对接方法!
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qiyenaihe
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求助关于autodock柔性对接方法!
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如题,新手才用autodock没多久,刚性对接大概会了,但是柔性对接不知道怎么弄。。。
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2014-12-10 12:59:51
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2014-12-11 08:53:45
我的做法是,通过刚性对接找到活性的口袋,然后将口袋pocket内有interaction 的残基定义成柔性保存,剩下的就是刚性结构。
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qiyenaihe
2楼
2014-12-11 06:30:12
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【答案】应助回帖
楼上正解!柔性残基可以是活性位点处重要的残基,比如说形成氢键的
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3楼
2014-12-15 20:22:18
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wbf3ng
at 2014-12-11 06:30:12
我的做法是,通过刚性对接找到活性的口袋,然后将口袋pocket内有interaction 的残基定义成柔性保存,剩下的就是刚性结构。
你好,具体操作步骤能不能发我一下呢?
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4楼
2014-12-15 22:33:54
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4楼
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qiyenaihe
at 2014-12-15 22:33:54
你好,具体操作步骤能不能发我一下呢?...
你把文件发给我,我做好了,再发给你
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5楼
2014-12-16 05:48:38
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5楼
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wbf3ng
at 2014-12-16 05:48:38
你把文件发给我,我做好了,再发给你
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课题.txt
2014-12-16 10:14:50, 104 bytes
6楼
2014-12-16 10:14:55
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