应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 求助关于autodock柔性对接方法！
61/1返回列表
查看: 2104  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

qiyenaihe

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助关于autodock柔性对接方法！ 已有2人参与

如题，新手才用autodock没多久，刚性对接大概会了，但是柔性对接不知道怎么弄。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-12-10 12:59:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qiyenaihe(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2014-12-11 08:53:45
我的做法是，通过刚性对接找到活性的口袋，然后将口袋pocket内有interaction 的残基定义成柔性保存，剩下的就是刚性结构。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

qiyenaihe
2楼2014-12-11 06:30:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼上正解！柔性残基可以是活性位点处重要的残基，比如说形成氢键的
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-15 20:22:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiyenaihe

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2014-12-11 06:30:12
我的做法是，通过刚性对接找到活性的口袋，然后将口袋pocket内有interaction 的残基定义成柔性保存，剩下的就是刚性结构。

你好，具体操作步骤能不能发我一下呢？
赞一下 回复此楼
4楼2014-12-15 22:33:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by qiyenaihe at 2014-12-15 22:33:54
你好，具体操作步骤能不能发我一下呢？...

你把文件发给我，我做好了，再发给你

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2014-12-16 05:48:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiyenaihe

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wbf3ng at 2014-12-16 05:48:38
你把文件发给我，我做好了，再发给你
...

那就麻烦您啦！
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 弹簧糊精制备及关键性质研究_徐进.caj
    • 2014-12-16 10:11:16, 4.41 M
  • 附件 2 : ligand.pdb
    • 2014-12-16 10:11:44, 8.24 K
  • 附件 3 : receptor.pdb
    • 2014-12-16 10:11:48, 76.42 K
  • 附件 4 : 课题.txt
    • 2014-12-16 10:14:50, 104 bytes
6楼2014-12-16 10:14:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qiyenaihe 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 9/450 2026-08-23 10:59 by Tide man
[基金申请] 什么时候开奖？ +8 CrisMessi 2026-08-18 9/450 2026-08-23 10:49 by 旋风马1987
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 14/700 2026-08-23 10:30 by wrm
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 03:52 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭