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赵小斯

新虫 (初入文坛)

[求助] 植物RNA一直提不出来,是什么原因?已有2人参与

虽然知道RNA很难提,但是没想到这么难。浏览了小木虫大部分关于提RNA的帖子,也用了其中很多经验,但是还是提不出来。
我说一下实验过程,还望有经验的朋友指导一番。
首先研磨是在超净工作台里进行的,之前研钵用DEPC水泡过一夜,离心管和枪头都是买的无核酶的。
1、研钵预冷,在无核酶的离心管里先加入1ml trizol(trizol 用过全式金,罗氏,invitrogen,都没提出来
2、加液氮研磨,期间会加液氮三到四次,磨到变成粉末,迅速加入到离心管中(植物组织保证<50mg),充分震荡后静置10min。
3、加入200ul氯仿,充分震荡30s,静置15min
4、12000r/m 4℃离心15min,取400ul上清于新的管子(保证不吸到中间层),加入 500ul异丙醇后颠倒混匀,静置10min
5、12000r/m 4℃离心10min,去上清
6、加75%乙醇(DEPC水配置的),剧烈涡旋
7、12000r/m 4℃离心1min,去上清,再晾干
8、加30ulRNA溶解液。
测出来的A260/280有些是在2左右,但是一跑胶就变成弥散的带。(跑胶槽是用的公用的)
但是大部分都在1.6左右。
心急,不知道原因出在何处,有没有大神解答一下,不胜感激啊
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董博士

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
赵小斯: 金币+5, 有帮助 2014-12-07 20:32:32
说说我的经验:
1. 为什么植物组织保证<50mg?我一般都是100mg左右,太少了,也不好提取的
2. 研磨是至关重要的。
研磨没有必要在超净台中,但一定要在冰上。事先在冰山捶个小洞,差不多就是你研钵的大小。将预冷后的研钵放在洞上,加入液氮冷却,直到保持研钵中的液氮不再外溅。
然后,放入植物组织,在有不少液氮的时候,轻轻将组织敲碎,或研磨碎。在液氮挥发的差不多的时候,快速研磨成粉末;这个时候,时间不宜太长,如果觉得时间不够,就再加点液氮(加的时候一定要注意,研钵温度要低,不要把组织溅出来)
研磨好后,迅速将离心管中的 trizol倒入研钵中(要保证研钵温度要低),边倒边用钵棒均开,保证 trizol均匀的覆盖在粉末材料上。
以上过程一定要迅速再迅速。
这个时候,就可以把研钵放在实验台上了,在 trizol融化的过程中,要及时将材料和覆盖在材料上的 trizol混匀,这样就会保证RNA不会被降解了。
医学&amp;统计学
2楼2014-12-07 20:14:49
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赵小斯

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 董博士 at 2014-12-07 20:14:49
说说我的经验:
1. 为什么植物组织保证<50mg?我一般都是100mg左右,太少了,也不好提取的
2. 研磨是至关重要的。
研磨没有必要在超净台中,但一定要在冰上。事先在冰山捶个小洞,差不多就是你研钵的大小。将 ...

首先非常感谢你,我也认为我失败关键在第一步,但是trizol加到研钵里,我没这么做过,这样可以很有效的抑制内源酶么?因为trizol的味道好大。。
3楼2014-12-07 20:21:28
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chenzhu198

铁杆木虫 (著名写手)

版主

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
赵小斯: 金币+5, 有帮助 2014-12-08 15:15:13
我一般做法是:用酒精装满研钵,用火烧至酒精没有,后用液氮冷却……后面就按操作步骤就是……希望对你有帮助

[ 发自小木虫客户端 ]
红砖并进,理实交融!
4楼2014-12-08 09:30:29
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赵小斯

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by chenzhu198 at 2014-12-08 09:30:29
我一般做法是:用酒精装满研钵,用火烧至酒精没有,后用液氮冷却……后面就按操作步骤就是……希望对你有帮助

谢谢
5楼2014-12-08 09:54:25
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天心擎亮

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 赵小斯 at 2014-12-08 09:54:25
谢谢...

用试剂盒试试,不贵,几百块钱用好多次。还要注意的是最好带上口罩,以防呼吸、说话会有酶造成降解;手套多换新的;胶最好现用现做;电泳缓冲液换新的,这是最重要的,要是TAE缓冲液的话最好用一次就换
6楼2014-12-08 21:02:02
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赵小斯

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 天心擎亮 at 2014-12-08 21:02:02
用试剂盒试试,不贵,几百块钱用好多次。还要注意的是最好带上口罩,以防呼吸、说话会有酶造成降解;手套多换新的;胶最好现用现做;电泳缓冲液换新的,这是最重要的,要是TAE缓冲液的话最好用一次就换...

好的谢谢
7楼2014-12-09 09:58:21
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赵小斯

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 天心擎亮 at 2014-12-08 21:02:02
用试剂盒试试,不贵,几百块钱用好多次。还要注意的是最好带上口罩,以防呼吸、说话会有酶造成降解;手套多换新的;胶最好现用现做;电泳缓冲液换新的,这是最重要的,要是TAE缓冲液的话最好用一次就换...

我们都是买的trizol,我想问问你们研钵处理上有没有比较特别的?
8楼2014-12-09 09:59:08
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天心擎亮

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 赵小斯 at 2014-12-09 09:59:08
我们都是买的trizol,我想问问你们研钵处理上有没有比较特别的?...

我们不用研钵现在,我们用电钻在离心管里直接研磨,速度快,研磨充分
9楼2014-12-09 22:07:05
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天心擎亮

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 赵小斯 at 2014-12-09 09:59:08
我们都是买的trizol,我想问问你们研钵处理上有没有比较特别的?...

也有用研钵的,研钵和研磨杵用锡箔纸包好后干热灭菌3h,加液氮后研磨
10楼2014-12-09 22:09:15
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