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Bella0224

金虫 (小有名气)


[交流] 提取植物DNA,求助~~~

新手一枚。。。

用试剂盒提取植物DNA,100mg样品,液氮研磨,可是总提不出来。。。(电泳跑胶来着,就marker亮,其他神马都木有

请问大家用液氮研磨时是否要研磨20分钟左右才算是研磨充分呢?研磨过程中是否都要处于冷冻状态呢?

其他步骤都按照试剂盒走的啊。。。难道是过程中DNA被降解了???
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junminh

铜虫 (小有名气)


★ ★ ★
Bella0224(金币+1): 谢谢参与
gyfgood: 金币+2, 有帮助! 2012-09-21 14:42:27
提的是啥植物哦,提不出来??
量太多,一般20MG的组织就能提取10UG以上的DNA。
研磨不以时间来界限,加液氮3-5次研磨即3-5分钟就差不多了,看成粉沫状就OK了。DNA没有你想的那么脆弱,提不出来肯定是有原因的。分析下。
2楼2012-09-20 10:17:54
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Bella0224

金虫 (小有名气)


因为之前木有做过,所以就拿身边的东南景天叶片练手来着。。。

今儿重新提了一次,加液氮磨了20分钟,用的100mg样品,最后泡胶除了marker其他地方一点亮带都木有,快哭了。。。

用的康为世纪的提植物DNA试剂盒,提了快5次了,一点木有。。。严格按照说明书了。。。

打算明儿给试剂公司打电话问问看。。。(会不会是试剂盒的问题啊???)
4楼2012-09-20 17:40:35
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junminh

铜虫 (小有名气)


详细描述下。
5楼2012-09-20 19:24:11
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junminh

铜虫 (小有名气)


起始量太大,研磨时间不必那么长,究竟用啥试剂盒提的?详细按说明书操作一次。
6楼2012-09-20 19:26:17
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deepbluewater

银虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
Bella0224(金币+1): 谢谢参与
gyfgood: 金币+5, 很有帮助! 2012-09-21 20:59:58
植物的话,真心不建议用试剂盒,因为植物当中的后含物,或其他物质对提取的干扰很大,比如我原来提取过一个植物中多糖和酚类很多,用试剂盒真心提不出来,后来是根据植物所含化学物质的特点改良设计了CTAB提取法,才能提取到不错的DNA,植物DNA相对于动物的来说还是要娇嫩一些,比较容易降解,所以你提取时要控制好裂解时间,和手部动作的力度。
7楼2012-09-21 19:26:04
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deepbluewater

银虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by Bella0224 at 2012-09-20 17:40:35
因为之前木有做过,所以就拿身边的东南景天叶片练手来着。。。

今儿重新提了一次,加液氮磨了20分钟,用的100mg样品,最后泡胶除了marker其他地方一点亮带都木有,快哭了。。。

用的康为世纪的提植物DNA试剂盒 ...

别着急,植物DNA真心不如动物DNA好提取,我做课题时也是弄了好久,都提不出来,当时也是很急,因为之前是做过的,竟然做不出来,挺自责的,结果导师还安慰我,有时候真的也跟周围气候什么有关,貌似我是国庆结束后没两天,就算不认真做都能提取出DNA来
8楼2012-09-21 19:28:26
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xiangyubaoer

金虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主说的那种试剂盒我们没有用过,我们实验室用的是天根的,可以提出来。液氮研磨不是要看时间,是要看粉末研磨是否够细。楼上有人提到CTAB法,这的确是个好方法,效率比试剂盒好得多,楼主可以试试。
9楼2012-09-21 19:37:51
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robinho

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
问题不会出在前面研磨20分钟上,我动植物都提过,动物组织放在水浴锅了一夜都不会有事,DNA没那么脆弱,所以问题肯定还在在后面,尽量不雅试验试剂盒。这个过程很简单的。
10楼2012-09-21 20:04:49
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匿名

用户注销 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
11楼2012-09-23 07:11:06
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Bella0224

金虫 (小有名气)


引用回帖:
8楼: Originally posted by deepbluewater at 2012-09-21 19:28:26
别着急,植物DNA真心不如动物DNA好提取,我做课题时也是弄了好久,都提不出来,当时也是很急,因为之前是做过的,竟然做不出来,挺自责的,结果导师还安慰我,有时候真的也跟周围气候什么有关,貌似我是国庆结束后 ...

真心感谢~~我最近快被这个急死了。。。马上要进行开题报告了,什么都还没弄出来。。。
12楼2012-11-07 09:50:27
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12101008

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
似乎提取DNA没那么难吧,研磨也不需要那么久的时间,还有就是你选的植物那个部位那个时期的组织呢?
13楼2012-11-07 17:01:42
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titus0805

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
提DNA就是样品量别大了,或者把裂解液的量提上去也行,方法里写的样品量一般都大,用不着研磨20分钟,一两分钟就够了。你要提细胞核建库那就另当别论了
14楼2012-11-09 08:58:14
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zzz888

铁杆木虫 (正式写手)



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楼主一直没说自己提的什么植物组织
提DNA没有你想想中那么麻烦的
我用天根的试剂盒
15楼2012-11-09 13:14:01
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Bella0224

金虫 (小有名气)


引用回帖:
15楼: Originally posted by zzz888 at 2012-11-09 13:14:01
楼主一直没说自己提的什么植物组织
提DNA没有你想想中那么麻烦的
我用天根的试剂盒

东南景天的叶片组织,我们这边做血液和质粒的都用的天根,貌似还是这个牌子比较不错。。。。
16楼2012-11-13 14:34:55
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Bella0224

金虫 (小有名气)


引用回帖:
11楼: Originally posted by 彬心玉壶 at 2012-09-23 07:11:06
磨成粉末,不用花那么大力气,样品不用很多。
不要用试剂盒,浪费钱。经典的CTAB就可以了。
DNA很皮实,随便整。

他们都说DNA很皮实,估计是我手法不行吧,表示刚做实验半年而已。。。
17楼2012-11-13 14:35:36
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295446821

银虫 (初入文坛)



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提取植物的DNA用经典的CTAB法就可以啊,其实点用的时候没必要点marker,浪费!
18楼2013-09-17 09:11:02
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Ophiorrhiza

新虫 (初入文坛)



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引用回帖:
4楼: Originally posted by Bella0224 at 2012-09-20 17:40:35
因为之前木有做过,所以就拿身边的东南景天叶片练手来着。。。

今儿重新提了一次,加液氮磨了20分钟,用的100mg样品,最后泡胶除了marker其他地方一点亮带都木有,快哭了。。。

用的康为世纪的提植物DNA试剂盒 ...

最近我也在提取植物DNA,也是用康为世纪的试剂盒,提出的总DNA在跑胶中也是这样的。后来我去测浓度,一般都是10纳克/微升左右,浓度太低,扩增小片段600-1000bp没问题,但上两千就没则。
19楼2014-09-20 11:43:24
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yangqingxy

铜虫 (小有名气)



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楼主提出来了吗?我也在用康为的试剂盒,DNA也是提不出来,总是降解,RNA含量很高,郁闷死了
20楼2014-12-23 21:17:40
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马袋袋

新虫 (初入文坛)



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我现在开始做植物基因组试剂盒的研发,争取弄个好用的出来
21楼2015-04-10 15:28:41
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WQS1991

银虫 (正式写手)



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引用回帖:
7楼: Originally posted by deepbluewater at 2012-09-21 19:26:04
植物的话,真心不建议用试剂盒,因为植物当中的后含物,或其他物质对提取的干扰很大,比如我原来提取过一个植物中多糖和酚类很多,用试剂盒真心提不出来,后来是根据植物所含化学物质的特点改良设计了CTAB提取法,才 ...

想问一下,你是怎么改良CTAB提取法的,具体细节能说一下吗?
22楼2015-04-19 21:06:09
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2012-09-20 16:29   回复  
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