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zhuxinzhe

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[交流] gromacs 中rdf问题

我的盒子里有12个相同的分子和其他的小分子，我想算这12个分子间的几何中心距离（center of geometry,COG）的RDF，但得出的曲线为什么不是连续的呢？我输入的命令是g_rdf -f .trr -s .tpr -n.ndx -rdf res_cog -o .xvg，我不知道-rdf res_cog是不是表示几何中心，求大神指教啊

gromacs 中rdf问题

Screenshot from 2014-12-04 19^%10^%41.png

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1楼 2014-12-05 14:30:21

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声梦奇缘001

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zhuxinzhe: 金币+10 2014-12-05 20:42:03

直接查看g_rdf -help就知道了

[ 发自小木虫客户端 ]

只做不说，明知没地位，坚信有机会

2楼2014-12-05 15:30:19

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