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qingtian510

银虫 (初入文坛)

[求助] gromacs4.5.5安装问题

我在Redhat5.5上安装Gromacs4.5.5,按照之前搜到的一种步骤安装:
GROMACS安装流程
   (1)首先在root用户下的.bashrc添加环境变量,这对安装非常重要。
    export PATH=$PATH:/home/个人用户名/lam-7.1.4/bin
    export CPPFLAGS=-I/home/个人用户名/fftw-3.3/include
    export LDFLAGS=-L/home/个人用户名/fftw-3.3/lib
    export PATH=$PATH:/home/个人用户名/gromacs-4.5.5/bin

  (2) 解压缩fftw,lam-mpi,gromacs源码 (我是手动解压的)
  tar -zxvf lam-7.1.4.tar.gz
    tar -zxvf fftw-3.3.tar.gz
  tar –zxvf gromacs-4.5.5.tar.gz
  
    (3) 编译lam-mpi
     cd lam-7.1.4
     ./configure
    make
   make install
    
  (4) 编译fftw单双精度版
  cd fftw-3.3
  ./configure
  make
  make install
 
  (5) 编译gromacs
     cd gromacs-4.5.5
      ./configure --prefix=/home/个人用户名/gromacs-4.5.5 --enable-mpi
   make
   make install
当运行到 ./configure --prefix=/home/个人用户名/gromacs-4.5.5 --enable-mpi 时,显示configure error: Cannot find fftw3f library,请教某位大侠给予周到下该怎么办?
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奋斗吧,少年
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lisuperyao

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
环境变量文件.bashrc 要source一下
2楼2013-09-07 19:16:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingtian510

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lisuperyao at 2013-09-07 19:16:44
环境变量文件.bashrc 要source一下

我记得好像试过source  .bashrc,不管用,我再试下,除了这个问题,还会不会是其他问题呢?
奋斗吧,少年
3楼2013-09-08 12:26:25
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在安装软件过程中遇到的很多问题,大多数都是可以通过google搜索来解决的。你这个问题就可以把出现的问题贴到google搜索中去检索,会找到很多类似的问题并且有处理办法的。
努力的生活着
4楼2013-09-09 10:48:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisuperyao

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by qingtian510 at 2013-09-08 12:26:25
我记得好像试过source  .bashrc,不管用,我再试下,除了这个问题,还会不会是其他问题呢?...

fftw编译还要有些指令  具体结合你的需求 百度一下 有很多例子的
5楼2013-09-09 13:21:21
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
qingtian510: 金币+5, 有帮助 2013-09-23 17:02:40
你在安装configure过程中,提示你缺少的库文件,是fftw单精度版的库文件。你在进行fftw configure的时候如果不加任何option,默认是进行双精度版本的configure。在你命令的基础上,加上“--enable-float“,应该就不会出现问题了。
努力的生活着
6楼2013-09-09 14:26:47
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