24小时热门版块排行榜    

查看: 2286  |  回复: 5

qingtian510

银虫 (初入文坛)

[求助] gromacs4.5.5安装问题

我在Redhat5.5上安装Gromacs4.5.5,按照之前搜到的一种步骤安装:
GROMACS安装流程
   (1)首先在root用户下的.bashrc添加环境变量,这对安装非常重要。
    export PATH=$PATH:/home/个人用户名/lam-7.1.4/bin
    export CPPFLAGS=-I/home/个人用户名/fftw-3.3/include
    export LDFLAGS=-L/home/个人用户名/fftw-3.3/lib
    export PATH=$PATH:/home/个人用户名/gromacs-4.5.5/bin

  (2) 解压缩fftw,lam-mpi,gromacs源码 (我是手动解压的)
  tar -zxvf lam-7.1.4.tar.gz
    tar -zxvf fftw-3.3.tar.gz
  tar –zxvf gromacs-4.5.5.tar.gz
  
    (3) 编译lam-mpi
     cd lam-7.1.4
     ./configure
    make
   make install
    
  (4) 编译fftw单双精度版
  cd fftw-3.3
  ./configure
  make
  make install
 
  (5) 编译gromacs
     cd gromacs-4.5.5
      ./configure --prefix=/home/个人用户名/gromacs-4.5.5 --enable-mpi
   make
   make install
当运行到 ./configure --prefix=/home/个人用户名/gromacs-4.5.5 --enable-mpi 时,显示configure error: Cannot find fftw3f library,请教某位大侠给予周到下该怎么办?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高分子学习--qlh

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

奋斗吧,少年
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisuperyao

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
环境变量文件.bashrc 要source一下
2楼2013-09-07 19:16:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingtian510

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lisuperyao at 2013-09-07 19:16:44
环境变量文件.bashrc 要source一下

我记得好像试过source  .bashrc,不管用,我再试下,除了这个问题,还会不会是其他问题呢?
奋斗吧,少年
3楼2013-09-08 12:26:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在安装软件过程中遇到的很多问题,大多数都是可以通过google搜索来解决的。你这个问题就可以把出现的问题贴到google搜索中去检索,会找到很多类似的问题并且有处理办法的。
努力的生活着
4楼2013-09-09 10:48:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisuperyao

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by qingtian510 at 2013-09-08 12:26:25
我记得好像试过source  .bashrc,不管用,我再试下,除了这个问题,还会不会是其他问题呢?...

fftw编译还要有些指令  具体结合你的需求 百度一下 有很多例子的
5楼2013-09-09 13:21:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
qingtian510: 金币+5, 有帮助 2013-09-23 17:02:40
你在安装configure过程中,提示你缺少的库文件,是fftw单精度版的库文件。你在进行fftw configure的时候如果不加任何option,默认是进行双精度版本的configure。在你命令的基础上,加上“--enable-float“,应该就不会出现问题了。
努力的生活着
6楼2013-09-09 14:26:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qingtian510 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +3 瞬息宇宙 2026-09-01 5/250 2026-09-02 08:01 by anjeeshine
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-09-02 00:19 by xiangy672
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
信息提示
请填处理意见