| 查看: 1550 | 回复: 4 | |||||||
zhangmao511铁虫 (小有名气)
|
[求助]
Gromacs膜蛋白添加水模拟的一个问题已有1人参与
|
|
想请教一个Gromacs里模拟膜蛋白的问题。 我已经把蛋白嵌入到膜内,接下来,需要将我的膜蛋白系统溶于水中。也就是添加水分子。那是直接用genebox命令添加水分子(如图1,膜2侧被加上了水);还是先editconf设定好一个水盒子形状,再用genebox命令添加水分子呢(如图2,整个膜蛋白体系被水分子包裹住了)?? 谢谢!! 图1: 1.jpg 图2: 2.jpg |
» 猜你喜欢
职称评审没过,求安慰
已经有14人回复
投稿Elsevier的Neoplasia杂志,到最后选publishing options时页面空白,不能完成投稿
已经有15人回复
毕业后当辅导员了,天天各种学生超烦
已经有4人回复
EST投稿状态问题
已经有4人回复
聘U V热熔胶研究人员
已经有10人回复
求助文献
已经有3人回复
垃圾破二本职称评审标准
已经有10人回复
投稿返修后收到这样的回复,还有希望吗
已经有8人回复
三无产品还有机会吗
已经有6人回复
谈谈两天一夜的“延安行”
已经有13人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
amber 里生成pdb文件的命令
已经有8人回复
用gromacs跑膜动力学
已经有3人回复
加膜系统的蛋白动力学模拟
已经有5人回复
分子动力学模拟轨迹文件格式的选择问题
已经有4人回复
如何将amber的轨迹文件mdcrd格式转换成gromacs的轨迹文件格式 trr呢
已经有5人回复
gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子
已经有19人回复
请教gromacs蛋白与小分子相互作用分析
已经有12人回复
Gromacs能量最小化问题
已经有5人回复
菜鸟。请问如何用gromacs模拟,水和油不容分层??
已经有4人回复
跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容,为什么?
已经有4人回复
Amber 分子动力学 求助!!!!
已经有10人回复
选择学习charmm还是amber呢?
已经有10人回复
Gromacs粗粒化力场(自己写)
已经有11人回复
300金币求帮忙解决个PMF相关的问题
已经有10人回复
有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟
已经有14人回复
分子模拟时间越长越好吗?
已经有44人回复
【求助】modeller同源建模结果选择
已经有10人回复
【求助】水盒子问题
已经有17人回复
【求助】namd tutorial遇到问题
已经有10人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangmao511: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常有帮助,悉心的指导,感谢+感动!!! 2014-11-10 15:08:25
感谢参与,应助指数 +1
zhangmao511: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常有帮助,悉心的指导,感谢+感动!!! 2014-11-10 15:08:25
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学













回复此楼