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宋伟同学

铜虫 (著名写手)

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[交流] 如何设计RTPCR引物，用什么软件和网站。谢谢大神。已有6人参与

是做果蝇的神经生物学，谢谢大神。

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1楼 2014-11-03 21:09:15

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wendywan

铁杆木虫 (小有名气)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-11-04 22:52:45

我一般用两种方式来找RT-PCR primer，成功率高！
1 找文章中的已报到的引物，这个一般是99%的成功率，有时小杂志的primer有点不太完美。
2 直接在线设计，用NCBI中的blast，把mRNA序列放进去，长度100-400bp，挺好用的，或者有些把CD序列搁进去，primer-blast。选择3-4对进行合成即可。这个也基本上都会有想要的。

以上的引物p出来的产物，如果条带正确，挑选一两对测序下，看看产物是否正确。
这算是最简单的了，我感觉。不用费脑子。。。。呵呵