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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 大家帮忙给出个主意，分子生物方面的。
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yxybbg

新虫 (小有名气)

[求助] 大家帮忙给出个主意，分子生物方面的。已有2人参与

大家好，我想研究牡丹的组培生根过程的分子机制，我想在其他物种里面找到与生根密切相关的几个关键基因，然后看在牡丹的基因组中能不能扩增出相应的片段，然后进一步研究这个基因在牡丹组培苗中的表达模式，大家觉得这种想法可行吗？我如何去找合适的基因？
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1楼2014-10-28 15:50:54
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冉兆星

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
yxybbg(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-10-29 08:49:29
可以在其他物种里面找与生根密切相关的几个关键基因在牡丹里的同源基因，然后敲除给基因，看看对生根过程的影响。祝好！
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2楼2014-10-28 18:16:10
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yxybbg

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 冉兆星 at 2014-10-28 18:16:10
可以在其他物种里面找与生根密切相关的几个关键基因在牡丹里的同源基因，然后敲除给基因，看看对生根过程的影响。祝好！

谢谢！是不是得做个预实验？因为别的物种与生根密切相关的基因在牡丹里面不一定有同源基因，是这样吗？这实验做下来得多长时间？我原来没做过分子，做起来会不会难度很大？
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3楼2014-10-28 21:01:05
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冉兆星

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yxybbg at 2014-10-28 21:01:05
谢谢！是不是得做个预实验？因为别的物种与生根密切相关的基因在牡丹里面不一定有同源基因，是这样吗？这实验做下来得多长时间？我原来没做过分子，做起来会不会难度很大？...

先做蛋白同源分析，如BLAST之类的。分子机制的研究实验都很慢，如果没有分子实验的基础，会有些难度。
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4楼2014-10-29 08:37:59
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yxybbg

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 冉兆星 at 2014-10-29 08:37:59
先做蛋白同源分析，如BLAST之类的。分子机制的研究实验都很慢，如果没有分子实验的基础，会有些难度。...

只做几个基因的克隆和序列分析，难度大吗？主要是想急着毕业，要文章。核心就行。
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5楼2014-10-29 09:08:24
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冉兆星

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yxybbg at 2014-10-29 09:08:24
只做几个基因的克隆和序列分析，难度大吗？主要是想急着毕业，要文章。核心就行。...

序列分析不难，你指的克隆是什么？只把基因扩增出来，还是打算构建相应基因的突变株？
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6楼2014-10-29 11:12:22
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xfxycy3090

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果牡丹基因组已经测序，你直接拿别的物种的目的基因序列去比对，找到牡丹的目的基因，根据序列设计引物，扩增。如果牡丹基因组没有测序，你可以多找几个牡丹亲缘关系较近的物种的目的基因序列，比对分析找出保守区域，设计简并引物，扩增牡丹的目的基因。简并引物设计软件可以使用在线的icodehop。
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7楼2014-10-29 16:12:59
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yxybbg

新虫 (小有名气)
只是把基因扩增出来，并作一下序列分析，因为还不知道这种基因在牡丹里面对生根是不是也很关键。因为牡丹的基因组也不清楚。
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8楼2014-10-29 16:59:16
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yxybbg

新虫 (小有名气)
怎么找生根的关键基因和进行引物设计？谁能给提供一个大体的步骤，谢谢！
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9楼2014-10-29 17:00:22
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real-time

至尊木虫 (著名写手)
做反向遗传验证，基因敲除
或者基因克隆后转基因到缺少相应基因的拟南芥验证
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一步法逆转录RNA多重实时荧光定量PCR课题服务QQ461749807
10楼2014-10-31 08:50:19
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