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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD所用的CHARMM力场参数除了22 27 还有别的吗？
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红颜不美

金虫 (正式写手)

[交流] NAMD所用的CHARMM力场参数除了22 27 还有别的吗？ 已有3人参与

NAMD所用的CHARMM力场参数除了关于蛋白质、脂类的22 27 还有别的吗？
有没有出新的参数文件？去哪儿找？
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计算模拟biubiu
1楼 2014-08-19 15:52:34
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布尔乔雅

新虫 (小有名气)
★
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送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 红颜不美 at 2014-08-21 09:12:32
我想问您一下charmm网站显示其程序包都出到charmm40了 那么它的参数文件要去哪儿下 目前参数文件我只找到了22与27...

请问楼主  你的charmm27力场的参数是在哪找的  能否发我一份吗？
本人新手  不太清楚charmm力场中的atom type都是怎么定义的
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7楼2017-10-19 17:07:07
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 鼓励交流 2014-12-25 07:44:48
charmm有其他力场
建议看看
http://en.wikipedia.org/wiki/CHARMM
http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml
http://www.charmm.org/package/releases.html
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-08-20 09:57:56
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红颜不美

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-08-20 09:57:56
charmm有其他力场
建议看看
http://en.wikipedia.org/wiki/CHARMM
http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml
http://www.charmm.org/package/releases.html

我想问您一下charmm网站显示其程序包都出到charmm40了 那么它的参数文件要去哪儿下 目前参数文件我只找到了22与27
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布尔乔雅
计算模拟biubiu
3楼2014-08-21 09:12:32
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 红颜不美 at 2014-08-21 09:12:32
我想问您一下charmm网站显示其程序包都出到charmm40了 那么它的参数文件要去哪儿下 目前参数文件我只找到了22与27...

http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml 应该是这里下载力场 C37 C36，适用范围看文献
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2014-08-21 09:38:47
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