应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD所用的CHARMM力场参数除了22 27 还有别的吗？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 2131  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

红颜不美

金虫 (正式写手)

[交流] NAMD所用的CHARMM力场参数除了22 27 还有别的吗？ 已有3人参与

NAMD所用的CHARMM力场参数除了关于蛋白质、脂类的22 27 还有别的吗？
有没有出新的参数文件？去哪儿找？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
计算模拟biubiu
1楼 2014-08-19 15:52:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 鼓励交流 2014-12-25 07:44:48
charmm有其他力场
建议看看
http://en.wikipedia.org/wiki/CHARMM
http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml
http://www.charmm.org/package/releases.html
赞一下(1人) 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-08-20 09:57:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红颜不美

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-08-20 09:57:56
charmm有其他力场
建议看看
http://en.wikipedia.org/wiki/CHARMM
http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml
http://www.charmm.org/package/releases.html

我想问您一下charmm网站显示其程序包都出到charmm40了 那么它的参数文件要去哪儿下 目前参数文件我只找到了22与27
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

布尔乔雅
计算模拟biubiu
3楼2014-08-21 09:12:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 红颜不美 at 2014-08-21 09:12:32
我想问您一下charmm网站显示其程序包都出到charmm40了 那么它的参数文件要去哪儿下 目前参数文件我只找到了22与27...

http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml 应该是这里下载力场 C37 C36，适用范围看文献
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2014-08-21 09:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红颜不美

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2014-08-21 09:38:47
http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml 应该是这里下载力场 C37 C36，适用范围看文献...

这个我下过了 还是谢谢您了
赞一下 回复此楼
计算模拟biubiu
5楼2014-08-21 10:00:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水月笼沙

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 红颜不美 at 2014-08-21 10:00:25
这个我下过了 还是谢谢您了...

楼主，找到了么？我现在也需要下载，可是找不到在哪儿
赞一下 回复此楼
6楼2014-12-24 19:54:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

布尔乔雅

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 红颜不美 at 2014-08-21 09:12:32
我想问您一下charmm网站显示其程序包都出到charmm40了 那么它的参数文件要去哪儿下 目前参数文件我只找到了22与27...

请问楼主  你的charmm27力场的参数是在哪找的  能否发我一份吗？
本人新手  不太清楚charmm力场中的atom type都是怎么定义的
赞一下 回复此楼
7楼2017-10-19 17:07:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红颜不美

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 布尔乔雅 at 2017-10-19 17:07:07
请问楼主  你的charmm27力场的参数是在哪找的  能否发我一份吗？
本人新手  不太清楚charmm力场中的atom type都是怎么定义的...

在charmm的官网上找的 我记得

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
计算模拟biubiu
8楼2017-10-21 19:15:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 红颜不美 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +7 青春裁为三截 2026-03-29 7/350 2026-03-30 13:14 by laoshidan
[考研] 085602 化学工程专硕 340分求调剂 +4 qianbai11 2026-03-29 4/200 2026-03-30 11:34 by 唐沐儿
[考研] 311求调剂 +10 lin0039 2026-03-26 10/500 2026-03-30 10:26 by herarysara
[考研] 299求调剂 +10 15188958825 2026-03-25 10/500 2026-03-29 17:51 by 王亮_大连医科大
[考研] 329求调剂 +10 钮恩雪 2026-03-25 10/500 2026-03-29 13:32 by peike
[考研] 283求调剂 +3 A child 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:41 by ms629
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[考研] 292求调剂 +14 鹅鹅鹅额额额额� 2026-03-25 15/750 2026-03-28 08:45 by WYUMater
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-27 7/350 2026-03-28 07:43 by 热情沙漠
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +4 钢铁大炮 2026-03-24 4/200 2026-03-26 16:28 by dick_runner
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭