| 查看: 1422 | 回复: 4 | |||
astringent铜虫 (著名写手)
|
[交流]
【求助】求助psf文件的生成
|
| 大家好，初学namd，但是一直停留在生成psf文件阶段。我按照说明书的指示：用写字板写一些内容，保存时要求：文件名为ubq.pgn，文件类型选择文本文档。可是在保存时遇到下面问题：（1）文件名写成ubq.pgn可是点保存后自动就变成ubq.pgn.txt格式了。于是我就利用复制粘贴并更改扩展名的方法把ubq.pgn.txt变成ubq.pgn，但是在执行后面操作source ubq.pgn时，又提示 couldn't read file "ubq.pgn": no such file or directory ，我确定我的路径没错，而且目录中存在ubq.pgn。请各位大侠指教，不甚感激。 |
回复此楼» 猜你喜欢
299求调剂
已经有4人回复
-
材料与化工专硕调剂
已经有6人回复
-
086500 325 求调剂
已经有3人回复
-
材料080500调剂求收留
已经有7人回复
-
一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600
已经有6人回复
-
环境工程调剂
已经有9人回复
-
工科材料085601 279求调剂
已经有9人回复
-
287求调剂
已经有5人回复
-
22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术
已经有3人回复
-
289求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求助】产生psf文件时出现的Missing atoms for conformation definition
已经有8人回复
- 【求助】加水后 碳纳米管不见了（已解决）
已经有4人回复
- 【求助】在NAMD运行中使用CHARMM格式的力场文件，但力场参数来自AMBER力场，会出问题�
已经有4人回复
- 【求助】无法生成环糊精的psf文件
已经有4人回复
- 【求助】用什么软件可以建立细胞膜嵌套蛋白质体系模型
已经有10人回复
- 【求助】如何合并文件 pdb psf
已经有4人回复
- 【求助】想问问在siesta中生成赝势的时候是需要新建一个src文件夹吗？
已经有3人回复
- 【求助】请教在ATK中怎样使用自己的或者Siesta的赝势
已经有4人回复
- 【求助】siesta输入文件中赝势文件的作用？
已经有8人回复
- 【求助】有没有用DS软件做细胞膜的模拟的？
已经有7人回复
- 【求助】siesta运行需要.psf文件吗
已经有4人回复
- 【求助】如何生成聚乙烯的psf文件
已经有11人回复
- 【求助】只是优化后文件，没有restart文件，能继续跑吗
已经有22人回复
- 【求助】psf文件的生成
已经有19人回复
- 【求助】有人模拟过电泳吗
已经有9人回复
- 【求助】namd tutorial遇到问题
已经有10人回复
liqingwen
木虫 (正式写手)
独行者
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1272.9
- 散金: 121
- 红花: 3
- 帖子: 406
- 在线: 156.6小时
- 虫号: 777960
- 注册: 2009-05-23
- 专业: 理论和计算化学
2楼2010-09-27 21:45:35
luokei
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 35.1
- 散金: 16
- 帖子: 68
- 在线: 33.4小时
- 虫号: 1071586
- 注册: 2010-08-09
- 性别: GG
- 专业: 分子设计与分子模拟
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-10-09 09:53:13
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-10-09 09:53:13
3楼2010-10-09 09:10:33
bluewhale
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 8438.3
- 散金: 50
- 红花: 10
- 帖子: 890
- 在线: 362.2小时
- 虫号: 278289
- 注册: 2006-09-10
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
4楼2010-10-10 21:49:18
5楼2018-01-23 18:51:33
