24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 892  |  回复: 3

wocause

银虫 (小有名气)

[求助] PCR特异性引物设计 已有1人参与

最近打算做ITS特异性引物进行PCR鉴别的实验,查了下NCBI相关的序列很多,且不一致,从中随机选了几条序列用Mega进行多序列比对,序列间居然有很多的空位(见附图),按说同一段序列,物种的亲缘关系也不算太远的话,不应该出现这样的问题啊。着实不解!这个问题是出在哪儿呢?另如何通过多序列比对来进行引物设计呀???求各位大神指导,不胜感激!

PCR特异性引物设计
1.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-01 23:53:08
扩18s进行菌种鉴定?直接用ITS1/ITS4通用引物做PCR就行了。给公司说做18s菌种鉴定的引物他们就明白了。你在网上随机找的片段本身亲缘关系就不一样,出现差异太正常了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

大家相互帮助哈
2楼2014-08-01 22:48:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wocause

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-08-01 22:48:42
扩18s进行菌种鉴定?直接用ITS1/ITS4通用引物做PCR就行了。给公司说做18s菌种鉴定的引物他们就明白了。你在网上随机找的片段本身亲缘关系就不一样,出现差异太正常了。

是为了建立一种新的鉴定方法,不用测序,直接电泳就可以检测出真伪。我是做中药鉴定的,不是菌种。求指导
3楼2014-08-02 10:04:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luwei13566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wocause at 2014-08-02 10:04:26
是为了建立一种新的鉴定方法,不用测序,直接电泳就可以检测出真伪。我是做中药鉴定的,不是菌种。求指导...

你用ITS序列鉴定中药~?请详细说一下你的这个鉴定方法。
大家相互帮助哈
4楼2014-08-02 23:11:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wocause 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 有没有学校材料专业收跨调(一志愿085410) +5 momo(上岸版) 2026-04-06 8/400 2026-04-09 15:07 by only周
[考研] 328求调剂 +17 lftmya 2026-04-07 18/900 2026-04-09 08:05 by 5268321
[考研] 一志愿211,化学310分,本科重点双非,求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-08 13/650 2026-04-08 21:17 by 学员tURuqU
[考研] 270求调剂 +3 031127 2026-04-06 4/200 2026-04-08 21:00 by 逆水乘风
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +19 披星河 2026-04-03 19/950 2026-04-07 15:14 by 尽舜尧1
[考研] 调剂 +4 mcbbc 2026-04-06 5/250 2026-04-07 12:33 by upczlm1989
[考研] 一志愿南航,数一英一学硕317求调剂!! +6 Acaciad 2026-04-04 6/300 2026-04-06 12:13 by 考研学校招点人
[考研] 求调剂 +10 chenxrlkx 2026-04-05 10/500 2026-04-06 11:31 by 猪会飞
[考研] 生物与医药086000调剂一志愿西北农林320分 +3 美美女士 2026-04-03 3/150 2026-04-05 21:55 by 学员8dgXkO
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 271分求调剂学校 +12 zph158488! 2026-04-02 13/650 2026-04-05 10:13 by lqwchd
[考研] 一志愿北京化工大学,初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考研] 0835学硕299求调剂 08大类可接受 +5 useryy 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:07 by 蓝云思雨
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +4 zhouzhen654 2026-04-03 4/200 2026-04-04 18:10 by 猪会飞
[考研] 一志愿东北大学085901土木专硕345求调剂 +3 zxt11111 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:21 by 土木硕士招生
[考研] 初试成绩337找调剂 +3 ??? ?. ? 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:43 by 土木硕士招生
[考研] 调剂 +7 祉岷. 2026-04-02 7/350 2026-04-03 09:11 by 花呗还欠600
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-04-02 3/150 2026-04-03 08:44 by yulian1987
信息提示
请填处理意见