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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 真菌18s扩增通用引物有哪些？哪些扩增较好啊，求序列。
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海风li

木虫 (正式写手)

[求助] 真菌18s扩增通用引物有哪些？哪些扩增较好啊，求序列。 已有1人参与

自己查了一下，有NS1、NS8和NS1、GC Fung
查到了这个
GC Fung: CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCGCCCCCGCCCC ATTCCCCGTTACCCGTTG
NS1: GTAGTCATATGCTTGTCTC
fung ATTCCCCGTTACCCGTTG
有点不懂，这是三个吗？那怎么用，不是正反两个吗？要合成引物的话，是不是合成NS1和Fung就行？
本人这方面菜鸟，急求解答！
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1楼 2014-06-23 10:41:10
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MaoNaiJi

金虫 (正式写手)
18 s rRNA基因片段设计引物为：
18sF：5’-AGGCGCGCAAATTACCCAATCC-3’，Tm=63.9 oC
18sR：5’-GCCCTCCAATTGTTCCTCGTTAAG-3’，Tm=61.9 oC
18s 核糖体RNA扩增通用序列 可以鉴定到属 以前我用过 你可以试试
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6楼2014-06-23 15:53:39
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ltfe567

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做DGGE的话三个都得合成，不做DGGE只需合成NS1 和Fung，这两个就可以
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2楼2014-06-23 10:55:23
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海风li

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ltfe567 at 2014-06-23 10:55:23
做DGGE的话三个都得合成，不做DGGE只需合成NS1 和Fung，这两个就可以

我只是检测几株从泥样里面分离出来的真菌属于哪个属，那应该用这两个就行吧？还有NS1、NS8和NS1、Fung哪对扩增更好一些啊？
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3楼2014-06-23 12:00:32
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ltfe567

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
海风li: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢了 2014-06-23 15:00:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 海风li at 2014-06-23 12:00:32
我只是检测几株从泥样里面分离出来的真菌属于哪个属，那应该用这两个就行吧？还有NS1、NS8和NS1、Fung哪对扩增更好一些啊？...

刚好我这两对都试过，NS1和Fung结果相对好些，NS1和NS8有非特异性条带，你可以都试试，合成一条引物也没多钱的
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海风li
4楼2014-06-23 13:43:07
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