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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 急求芽孢杆菌的通用引物！！！
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jerryzyy

金虫 (小有名气)

[求助] 急求芽孢杆菌的通用引物！！！已有4人参与

最近一直在做芽孢杆菌的克隆文库，但是从英文文献里看到的通用引物，自己测序回来都不是芽孢杆菌，马上要毕业了，愁死了，希望高手帮帮忙！！！不胜感激！
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1楼2014-04-16 21:17:10
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xiaoamuchong

专家顾问 (职业作家)

科研工作者

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助！ 2014-04-17 08:51:23
用于16S rRNA基因扩增的细菌通用引物为
K1: 5′-aactgaagagtttgatcctggctc-3′,
K2: 5′-tacggt taccttgttacgactt-3′,
分别位于大肠杆菌16S rDNA 的2~25 nt 和1479~1500 nt 。
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曾经有人问我为什么要学微生物，我只是想离生命的本质更近一点。
2楼2014-04-16 21:24:51
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jerryzyy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoamuchong at 2014-04-16 21:24:51
用于16S rRNA基因扩增的细菌通用引物为
K1: 5′-aactgaagagtttgatcctggctc-3′,
K2: 5′-tacggt taccttgttacgactt-3′,
分别位于大肠杆菌16S rDNA 的2~25 nt 和1479~1500 nt 。

这个是细菌的吗，能扩增出芽孢杆菌吗
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3楼2014-04-16 21:30:50
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huangrui1988

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
个人觉得是不行的。。。。
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4楼2014-04-17 00:20:20
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xiaoamuchong

专家顾问 (职业作家)

科研工作者
引用回帖:
3楼: Originally posted by jerryzyy at 2014-04-16 21:30:50
这个是细菌的吗，能扩增出芽孢杆菌吗...

可以的。
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曾经有人问我为什么要学微生物，我只是想离生命的本质更近一点。
5楼2014-04-17 02:39:13
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jerryzyy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaoamuchong at 2014-04-17 02:39:13
可以的。...

我想找芽孢杆菌的通用引物，芽孢杆菌属于细菌，但是扩增出来大部分是细菌，只有几个是芽孢杆菌
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6楼2014-04-17 09:19:50
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见神一笑

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by jerryzyy at 2014-04-17 09:19:50
我想找芽孢杆菌的通用引物，芽孢杆菌属于细菌，但是扩增出来大部分是细菌，只有几个是芽孢杆菌...

楼主，你可以自己根据芽孢杆菌的序列来设计引物啊，找到书籍的芽孢杆菌序列，和另外一些常见菌的序列比对一下，找出芽孢杆菌的特异序列设计引物
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好好努力
7楼2014-04-18 11:18:05
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119904386

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

265F1：5-GTGCTACAATGGACAGAACAA-3
265R1：5-GTGAGATGTTGGGTTAAGTC-3
52度退火
参考自《Restriction analysis and partial sequencing of the 16S rRNA gene as index for rapid identification of Bacillus species》通过扩增细菌 16SrRNA基因，发现芽孢杆菌中存在高度保守的 265bp 片段，建立了除蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌外芽孢杆菌的物种鉴定方法

我用过 感觉不太好用 你可以试试
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8楼2014-04-20 21:09:15
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