应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 要做DGGE，真菌有没有通用引物？
71/1返回列表
查看: 1499  |  回复: 6
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

dovekaoyan

木虫 (正式写手)

[求助] 要做DGGE，真菌有没有通用引物？

如题，细菌做DGGE一般是用16S，真菌的有没有，ITS还是18S，GC夹要用什么？我已经找了好多文献都没有找到，给出序列或者含序列的文献，金币全奉送，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2011-11-04 13:42:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)

嗨
参看我们的文章
Deng WD, Xi DM, Mao HM, Wanapat M. 2008. The use of molecular techniques based on ribosomal RNA and DNA for rumen microbial ecosystem studies: a review. Molecular Biology Reports. 35(2):265-274.


GC夹子是用于DGGE是拉开档次，便于分型鉴定
赞一下 回复此楼
嗨
2楼2011-11-04 15:23:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dovekaoyan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gayalynau at 2011-11-04 15:23:35:
参看我们的文章
Deng WD, Xi DM, Mao HM, Wanapat M. 2008. The use of molecular techniques based on ribosomal RNA and DNA for rumen microbial ecosystem studies: a review. Molecular Biology Reports. 3 ...

谢谢 但文章里面没有我要的内容
赞一下 回复此楼
3楼2011-11-04 16:14:03
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)

嗨
里关于DGGE的原文你应该系在后看看
赞一下 回复此楼
嗨
4楼2011-11-04 17:19:14
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冰鱼儿

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

ITS序列和18S 就可以啊
赞一下 回复此楼
5楼2011-11-04 17:27:50
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

dovekaoyan(金币+5): GC-Fung和NS1这一对我有，不知道你用过的ITS和18S的序列是什么？我知道很多，但是不晓得那一对是通用的，GC夹是什么序列，加在哪里？ 2011-11-07 16:55:54
引用回帖:
1楼: Originally posted by dovekaoyan at 2011-11-04 13:42:17:
如题，细菌做DGGE一般是用16S，真菌的有没有，ITS还是18S，GC夹要用什么？我已经找了好多文献都没有找到，给出序列或者含序列的文献，金币全奉送，谢谢

看到一篇文章中有真菌18S rDNA 的通用PCR引物，GC-Fung和NS1。这对引物应该是扩增效果最好的真菌通用引物，我们实验室曾经比较过几种，后来选啦这对。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-11-05 09:21:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Jiachao Zhang, Guangming Zeng, Yaoning Chen, Man Yu, Zhen Yu , Hui Li , Yong Yu , Hongli Huang. Effects of physico-chemical parameters on the bacterial and fungal communities during agricultural waste composting。 Bioresource Technology. 2011.102:2950-2956.
赞一下 回复此楼
7楼2011-11-05 09:23:12
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dovekaoyan 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭