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海风li

木虫 (正式写手)

[求助] 真菌18s扩增通用引物有哪些?哪些扩增较好啊,求序列。 已有1人参与

自己查了一下,有NS1、NS8和NS1、GC Fung
查到了这个
GC Fung: CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCGCCCCCGCCCC ATTCCCCGTTACCCGTTG
NS1: GTAGTCATATGCTTGTCTC
fung ATTCCCCGTTACCCGTTG
有点不懂,这是三个吗?那怎么用,不是正反两个吗?要合成引物的话,是不是合成NS1和Fung就行?
本人这方面菜鸟,急求解答!
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MaoNaiJi

金虫 (正式写手)

18 s rRNA基因片段设计引物为:
18sF:5’-AGGCGCGCAAATTACCCAATCC-3’,Tm=63.9 oC
18sR:5’-GCCCTCCAATTGTTCCTCGTTAAG-3’,Tm=61.9 oC
18s 核糖体RNA扩增通用序列 可以鉴定到属 以前我用过 你可以试试
6楼2014-06-23 15:53:39
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普通回帖

ltfe567

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
做DGGE的话三个都得合成,不做DGGE只需合成NS1 和Fung,这两个就可以
2楼2014-06-23 10:55:23
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海风li

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ltfe567 at 2014-06-23 10:55:23
做DGGE的话三个都得合成,不做DGGE只需合成NS1 和Fung,这两个就可以

我只是检测几株从泥样里面分离出来的真菌属于哪个属,那应该用这两个就行吧?还有NS1、NS8和NS1、Fung哪对扩增更好一些啊?
3楼2014-06-23 12:00:32
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ltfe567

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
海风li: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢了 2014-06-23 15:00:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 海风li at 2014-06-23 12:00:32
我只是检测几株从泥样里面分离出来的真菌属于哪个属,那应该用这两个就行吧?还有NS1、NS8和NS1、Fung哪对扩增更好一些啊?...

刚好我这两对都试过,NS1和Fung结果相对好些,NS1和NS8有非特异性条带,你可以都试试,合成一条引物也没多钱的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-06-23 13:43:07
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海风li

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by ltfe567 at 2014-06-23 13:43:07
刚好我这两对都试过,NS1和Fung结果相对好些,NS1和NS8有非特异性条带,你可以都试试,合成一条引物也没多钱的...

再求帮忙看一下,我查到的Fung序列对吧?
5楼2014-06-23 15:26:05
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ltfe567

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 海风li at 2014-06-23 15:26:05
再求帮忙看一下,我查到的Fung序列对吧?...

嗯嗯 序列对的
7楼2014-06-23 16:00:00
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不吃草叻羊

新虫 (初入文坛)

想请问一下楼主你用的是NS1和Fung 的引物吗,用的是什么扩增体系和程序啊。本来新手一个
8楼2016-02-04 15:50:21
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

丝状真菌鉴定最好是用ITS\BT\CMD,18S在篮状菌属和青霉属的权威分类上根本没见过。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
9楼2016-02-12 00:56:32
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柠檬树123456

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ltfe567 at 2014-06-23 13:43:07
刚好我这两对都试过,NS1和Fung结果相对好些,NS1和NS8有非特异性条带,你可以都试试,合成一条引物也没多钱的...

你好,目的条带大概多长呢

发自小木虫Android客户端
10楼2018-03-29 10:41:40
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