| 查看: 2213 | 回复: 5 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
a356926674金虫 (小有名气)
|
[求助]
AUTODOCK将蛋白受体保存成pdbqt格式的问题 已有1人参与
|
|
| 我想请教一下，就是我蛋白数据库中下载了3MQ1蛋白，这里面有两个残基，然后我按照autodock一步步操作，但是在用Grid想将蛋白保存成pdbqt时就会出现initializing 3MQ1.pdb:-contains no non-bonded atoms, 然后就是保存不了pdbqt的格式。这是为什么？ |
回复此楼» 猜你喜欢
申博/考博
已经有8人回复
-
291求调剂
已经有12人回复
-
一志愿A区211，22408 321求调剂
已经有8人回复
-
295分求调剂
已经有6人回复
-
一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗
已经有13人回复
-
085600材料与化工调剂
已经有6人回复
-
期刊推荐
已经有5人回复
-
有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业
已经有7人回复
-
又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗
已经有4人回复
-
337求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Autodock蛋白处理时，保留在蛋白的原配体如何处理？
已经有12人回复
- 在autodock软件中如何将配体和受体拆分开
已经有9人回复
- 如何将小分子Jmol格式转化为pdb格式
已经有4人回复
- Autodock对接构象准确性的评价——RMSD
已经有10人回复
- 请教关于AUTODOCK做虚i拟筛选的问题
已经有7人回复
- AutoDock大分子问题
已经有11人回复
- 用autodock对接，用什么软件定点突变蛋白质
已经有14人回复
- autodock对接时蛋白的处理问题
已经有6人回复
- Autodock中受体的准备
已经有14人回复
- autodock的安装
已经有10人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- Autodock的操作流程---win下
已经有565人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- AUTODOCK对接步骤求助(附图）
已经有7人回复
- autodock安装好后导入分子为什么不对（附图）
已经有18人回复
- AutoDock的安装？
已经有7人回复
- 【求助】autodock中PDB转pdbqt格式问题？
已经有9人回复
- 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢
已经有12人回复
- 【求助】Autodock运行时无法生成log文件？
已经有12人回复
- 【求助】关于Autodock中Grid中的问题
已经有9人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
a356926674
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1138.2
- 散金: 30
- 红花: 1
- 帖子: 262
- 在线: 97.3小时
- 虫号: 1254484
- 注册: 2011-04-03
- 专业: 植物进化生物学
3楼2014-06-18 21:28:50
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
a356926674: 金币+20, ★★★很有帮助, 您好，非常感谢，但是能不能说下你的操作方法呢，挺麻烦的，但是希望能有吧，谢谢 2014-06-18 20:05:26
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-19 14:52:06
感谢参与，应助指数 +1
a356926674: 金币+20, ★★★很有帮助, 您好，非常感谢，但是能不能说下你的操作方法呢，挺麻烦的，但是希望能有吧，谢谢 2014-06-18 20:05:26
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-19 14:52:06
| 拿去吧！金币来，呵呵 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 3MQ1.pdbqt
2014-06-18 18:07:24, 494.77 K
2楼2014-06-18 18:07:30
4楼2014-06-19 17:43:06
therotyonth
金虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2836.4
- 红花: 11
- 帖子: 955
- 在线: 68.9小时
- 虫号: 2349854
- 注册: 2013-03-15
- 专业: 理论和计算化学
5楼2014-08-22 10:01:18
50