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创造翅膀zcj

新虫 (初入文坛)

[求助] 去除基因组DNA的原理是什么?具体点! 已有4人参与

去除基因组DNA的原理是什么?具体点!
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liug268

金虫 (小有名气)

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你是在问RNA提取过程中去除基因组的原理吗?
基因组可能会干扰RT PCR的结果(如果你设计的引物不跨外显子),所以要去除。
一般都是用DNase去除,这种酶只切割双链的DNA,不会影响RNA。
2楼2014-06-09 22:47:28
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wangpeng227

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
问的是什么实验过程呢?具体点。

质粒提取?RNA提取?蛋白提取?
3楼2014-06-09 23:37:50
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快乐农夫

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
根据中心法则,RNA是由DNA的外显子部分转录而来,所以提RNA反转录成cDNA后再扩增目的片段,是不会把内含子扩进去的。如果你不除基因组DNA,扩增结果很难保证没有内含子,而目的片段中内含子的存在会极大的影响后续实验
4楼2014-06-10 08:30:33
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果你说的是RNA提取过程

在加入氯仿吸取上清那一步的时候,RNA在上层水相里,而DNA是在中间的酚-氯仿层相里了,然后抛弃了,所以基因组就不再你提取的RNA里了
当然,你接下来最好加入dnase,这样可以尽可能的消除残余的基因组

如果是对实验的影响,楼上讲的很透彻

就是rna翻转成CDNA来做实验,而cdna如果混在了DNA的话,会影响实验结果
天行健
5楼2014-06-10 09:25:05
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