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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 怎么找到一个基因的DNA序列
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jonew

木虫 (正式写手)

[求助] 怎么找到一个基因的DNA序列已有2人参与

如题，新手求助，在NCBI中找一个小麦中的SBEⅡb的DNA序列，谢谢！！！ 大家帮忙找一下啊
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借口很贱，，，
1楼2014-05-31 23:41:22
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zzyzeus

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-01 13:01:45
NCBI 搜该基因
找GENE数据库
点进去有各个基因在各种物种的信息
选择你要的物种点进去

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2014-05-31 23:43:22
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jonew

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zzyzeus at 2014-05-31 23:43:22
NCBI 搜该基因
找GENE数据库
点进去有各个基因在各种物种的信息
选择你要的物种点进去

还是没有找到呀 可以帮忙找一下么？
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借口很贱，，，
3楼2014-05-31 23:50:14
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zzyzeus

木虫 (著名写手)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-06-01 19:50:28
不知道这个序列对不对
请提供确切的基因名称
貌似看到的SBE2基因是在一种细菌里
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7楼2014-06-01 17:09:17
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主
引用回帖:
5楼: Originally posted by jonew at 2014-06-01 09:43:39
谢谢 这是cDNA序列，不是DNA谢谢你 啊...

不懂你到底要什么cDNA也是DNA啊
/region 81..2591
/gene="SBE IIb"
/codon_start=1
/product="starch branching enzyme IIb"
/protein_id="AAW80631.1"
/db_xref="GI:58618129"
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8楼2014-06-01 23:02:34
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shengwumin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 应助指数+1, 鼓励热心回帖交流 2014-06-03 18:44:14
引用回帖:
2楼: Originally posted by zzyzeus at 2014-05-31 23:43:22
NCBI 搜该基因
找GENE数据库
点进去有各个基因在各种物种的信息
选择你要的物种点进去

我给你举一个例子 比如人类的tp53基因序列
首先，打开ncbi网页，选择gene框输入human p53,点击search;
其次，在出来的众多基因中选择你想要的基因，打上对勾，点击进去；
再次，向下滑动鼠标，看到genbank字眼后，选择genbank,点击进入。
最后，你想要的DNA序列就呈现在你的面前了。
步骤就是下面的三张图啦 顺序为1,2,3.
祝你好运。
怎么找到一个基因的DNA序列
3.jpg


怎么找到一个基因的DNA序列-1
1.jpg


怎么找到一个基因的DNA序列-2
2.jpg
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believeyourself! come on .
10楼2014-06-03 16:47:47
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普通回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jonew: 金币+10 2014-06-01 09:43:44
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY740401.1
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4楼2014-06-01 05:35:51
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jonew

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-06-01 05:35:51
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY740401.1

谢谢 这是cDNA序列，不是DNA谢谢你 啊
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借口很贱，，，
5楼2014-06-01 09:43:39
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zzyzeus

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jonew at 2014-05-31 23:50:14
还是没有找到呀 可以帮忙找一下么？...

>gi|339998036:330893-332491 Salmonella bongori NCTC 12419, complete genome
TTGAAACATATATCAAATCGTGGATCAATCCTGATTGAGGTTATTATAGCTATTGCTATCATTGGTATGG
TTATGCTAGCTGCAGCTGAATATGCCAGAAAAGAAATAGATAAAGTACACCGACAAAATATATCTGACAT
CATTGTTAAGGAAATTTCCTCTTTTCTGGCGTTTATAAATCACTATGAGCTTGAAGTATATAAAGCAGAT
GGAACAACAGAAAAGAGGATAAATCCACTTTATGATATTCCCTCTCCAGGTACATCAGACTCACGGCCTG
ATTATTATAAAAATCGACTTCTGACAAAAATGGAGGATGATTTAAGTAACAATTTATCAAATTTTATCAA
CTGGGGAAGTTATAAAGCAGGAGGGACGAGCGCTGAGAGAAATTTTTTTCTTGACAGTGCTTGTGGTGGT
ACAGGTGCTGATTCAATTCCTGTAAACAAAACATCTGGAATGAAGTTTGTTAATCAATTTCTAAGTTGTG
AACGGAAATGGGAAAATAGTGAGTTTGACATTGAACGTGTAGATTTAATTGGCGACCAACGCACCGGTAG
TATTGATCGAGTTGATTTTTTTCTTTCTTTCAATGAAATAACAGAAAATAACGGTTTTGAGCTTTTTAAT
TATGTAACAAGTCTTGAGAGAGCCTTTGACAAGGCTGGCTATTTTGTTGCAGGCGCATACTTAATCAGCA
GGAATAAAGGTGGGGCAGCGCAAAACTGGGAGCTTGTAAAGAATGGCACAGGTACACCACCTCCAAGAGT
GGATGTGATGAAACCAGACGGTTATGATTTTCTTGGCAGACTTCCCCGTAATCTTCAATATGGCATCAGA
TTGAGTATGAAGGCGGACGGAATGAACCTGAAAGCAGATGGTTCGGTGAATGCAGAAAAATTATGCTGGG
ATCCTGTCAGCGATGCTCCGGTGATTTGCATTGCATCAAATAAATACAGTACTCATGATGATCCCATGCT
TAGTGCTACTGTTTCTCCGGGGCAGGATCCAGCATCACTTTCTGTTAAGGACCTTATTTTTAATAATGGG
GTAGGAACTAAACCTGATGGAACGACGTATAATAAATACAGTACTGTTCCTGTGATTGATTACGTAAGTT
TTACTGGTGAAAACAAGGCAAATATTAAAGTATCGGATAATTACTCTGCAAATGTTAACGATGAAGAAGG
ATTCATTAGACGTGATATACAAATATGTCCTTTAAATCCTGAAGGCGATGAAAGCAATCCCGGTAAGCCA
AAGCGGTTGTACCCGAGAATGGCTGTGGCGTTATCATCATTTGTTGGGGAGTCTCTTGATAATAACAGTA
AAACAATGTTGGATTCCGATCTTAGCAAGCTTAAATCTAATCGTAATAAGTTATCTTTGCTAAAAGGGCA
GGAAATTGATCAGATAAAGGGTATTGTTATTCAGGTTAACCAGTCGACAATAAATAAGCCATCAGGTGAA
TGGTTAATTTCAGCAAGTACAGGGCTTAAAAATGATGGGACGGGTGCTTACAATATCATTAACCCAAAAT
CATTATCTTTGCTTGTGACAACCTGGTGCAGTACGGAAGAACAGGACTCATTGCCATAA
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6楼2014-06-01 16:55:15
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shengwumin

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zzyzeus at 2014-05-31 23:43:22
NCBI 搜该基因
找GENE数据库
点进去有各个基因在各种物种的信息
选择你要的物种点进去

楼主基本上给你说了在NCBI中怎么找基因序列。在看到你的求帖后，我也给你找了找，若是限定关键字 wheat SBEⅡb去寻找，NCBI搜索没有记录。是不是你给的基因有另外的别名？还有，你给的基因名称确定是正确的？
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9楼2014-06-03 16:37:46
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