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baolidao237

木虫 (正式写手)

[求助] 弱弱的问一下,我测序得到一个DNA片段,大约50K长度,上面有几个基因,我如何查找?

如题:弱弱的问一下,我测序得到一个DNA片段,大约50K长度,上面有几个基因,我如何查找?

就是ATCGATGGGGGCATTTTAACCC..........................大概5万多个,里边包含多少个基因,去哪里查?查到的是目前确定的,没有查到的,是不是也包含未发现的基因?

如何在一个DNA序列里判断其中的一个基因?是不是得看启动子?还是有什么规律呢?

本人生物菜鸟,真心求助大哥们!
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

一般是用软件来自动判断可能的基因。没做过,帮顶下!
2楼2011-10-16 23:47:24
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love_st

金虫 (著名写手)


试着blast下,找下OFR,看都编码的什么蛋白...
3楼2011-10-17 09:16:48
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zc10052157

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

测这么长的基因,是要找新基因还是拿到已知基因
hold住
4楼2011-10-17 14:33:43
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syn1985

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

不知道你这是什么基因片段 你应该去查查做你那方面的文献 文献里面应该有写的
5楼2011-10-17 16:38:03
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

你是测的BAC, 图位克隆?
真相是最大的奢侈品
6楼2011-10-17 18:54:49
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doublehelix

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

baolidao237(金币+5): 1 2011-10-22 20:09:19
做ORF分析,再进行genbank比对分析
7楼2011-10-18 10:02:57
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