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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 弱弱的问一下，我测序得到一个DNA片段，大约50K长度，上面有几个基因，我如何查找？
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baolidao237

木虫 (正式写手)

[求助] 弱弱的问一下，我测序得到一个DNA片段，大约50K长度，上面有几个基因，我如何查找？

如题：弱弱的问一下，我测序得到一个DNA片段，大约50K长度，上面有几个基因，我如何查找？

就是ATCGATGGGGGCATTTTAACCC..........................大概5万多个，里边包含多少个基因，去哪里查？查到的是目前确定的，没有查到的，是不是也包含未发现的基因？

如何在一个DNA序列里判断其中的一个基因？是不是得看启动子？还是有什么规律呢？

本人生物菜鸟，真心求助大哥们！
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1楼 2011-10-16 20:13:37
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
一般是用软件来自动判断可能的基因。没做过，帮顶下！
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2楼2011-10-16 23:47:24
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love_st

金虫 (著名写手)
试着blast下，找下OFR，看都编码的什么蛋白...
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3楼2011-10-17 09:16:48
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zc10052157

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

测这么长的基因，是要找新基因还是拿到已知基因
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hold住
4楼2011-10-17 14:33:43
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syn1985

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

不知道你这是什么基因片段 你应该去查查做你那方面的文献 文献里面应该有写的
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5楼2011-10-17 16:38:03
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

你是测的BAC, 图位克隆?
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真相是最大的奢侈品
6楼2011-10-17 18:54:49
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doublehelix

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

baolidao237(金币+5): 1 2011-10-22 20:09:19
做ORF分析，再进行genbank比对分析
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7楼2011-10-18 10:02:57
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