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er66668888

铜虫 (初入文坛)

[求助] DGGE用一轮PCR产物好还是二轮PCR产物好已有3人参与

我没有用巢式PCR,只用一对引物扩增,一轮PCR产物做DGGE条带好少还比较暗,用二轮PCR产物感觉条带会多一些亮一些,那我是用二轮PCR产物做DGGE呢还是一轮呢,有做过的么,文献上没见有提到用二轮PCR产物做的。。。
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猪尾巴草

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-20 13:31:00
我没这样做过二轮PCR,我的做法是:一轮PCR是一对上下游引物,二轮PCR是另一对上下游引物,就是二轮pcr要比一轮PCR的碱基数少些,二轮PCR引物是针对一轮PCR设计的
2楼2014-05-20 12:44:01
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美亿美生物

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你用的是哪对引物?
3楼2014-05-20 16:13:22
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yijieyu1987

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我曾经做过巢式PCR,第二轮PCR引物根据第一轮PCR产物设计,上下游都往内几个-几十个碱基,这样避免PCR错配的产生,但又不影响目标片段的DGGE分析
4楼2014-05-20 17:12:58
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er66668888

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 美亿美生物 at 2014-05-20 16:13:22
你用的是哪对引物?

NS1/GCFUNG
5楼2014-05-21 15:57:47
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er66668888

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yijieyu1987 at 2014-05-20 17:12:58
我曾经做过巢式PCR,第二轮PCR引物根据第一轮PCR产物设计,上下游都往内几个-几十个碱基,这样避免PCR错配的产生,但又不影响目标片段的DGGE分析

我不用巢式pcr 我就一对引物
6楼2014-05-21 15:59:18
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美亿美生物

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引用回帖:
5楼: Originally posted by er66668888 at 2014-05-21 15:57:47
NS1/GCFUNG

做真菌的,直接加GC夹扩
7楼2014-05-21 17:12:44
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