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关于序列比对,建树的问题,很困惑!
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专业: 作物种质资源与遗传育种学
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]
关于序列比对,建树的问题,很困惑!
已有1人参与
我用MEGA5 做系统发育树,200个样,同一物种不同群居,刚开始做出来的树,bootstrap 值很低。不知道什么原因,后来我发现,用MEGA序列对比完,掐头去尾后,有一些序列没对上,是不是要对这些序列人工再进行调整啊?谢谢了
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1楼
2014-05-09 20:29:30
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专业: 生物信息学
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★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流
2014-05-11 08:59:58
最好是有手工调整这一步的,尽量避免引入gap。一般都是一样长度的,把头尾去掉
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2楼
2014-05-10 06:45:10
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