24小时热门版块排行榜    

查看: 4613  |  回复: 18
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

emmaya

新虫 (初入文坛)

[求助] RED重组敲除基因,PCR验证时既有目的基因条带也有打靶片段条带 已有4人参与

如题,欲敲除的是大肠杆菌K-12的C600分子伴侣GroEL基因,大小约为1700bp。用RED重组方法,电转入两边各带50bp同源臂的线性片段(大小约1100bp)后,对筛选出来的疑似敲除菌株抽基因组PCR验证。

引物为目的基因5’、3’端,扩增出来的条带有两条,既有没敲掉的原基因大小,也有线性片段的条带。

在目的基因上游和线性片段中间设计的一对引物,则只有一条带,且大小正确,理论上来讲线性片段应该交换到基因组上了;

对目的基因非同源臂部分,设计了一对引物,疑似敲除的菌株与原始菌扩增出来的条带大小一样,说明目的基因还在。

想请教,这个情况到底是为什么呢,怎么会两种情况同时出现,不是应该要么线性片段交换上要么没有吗?

不知道问题出在哪里,有没有大牛有相似的经历的,什么办法可以解决呢?求给点意见!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emmaya

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 韩蕾6862 at 2014-11-29 16:14:07
你现在找到原因了吗?我也遇到了相同的问题

没有找到原因,听虫友说这样的只能通过反复不断的尝试才可能获得正确的敲除菌,可以尝试不同的同源臂,能敲除的概率比较低
8楼2014-11-30 15:59:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

l68266152

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
99%的可能性是染菌了
相信自己
2楼2014-03-27 12:38:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emmaya

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2014-03-27 12:38:10
99%的可能性是染菌了

起初也怀疑是染菌了,我是用50ug/ml氯霉素筛选出来的单菌落,然后用同样的抗性摇菌,抽的基因组进行PCR的,这样还有可能是因为染菌吗?
3楼2014-03-27 16:02:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

l68266152

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by emmaya at 2014-03-27 16:02:06
起初也怀疑是染菌了,我是用50ug/ml氯霉素筛选出来的单菌落,然后用同样的抗性摇菌,抽的基因组进行PCR的,这样还有可能是因为染菌吗?...

仔细看了下,有可能是单交换,可以在目的基因“下游”和线性片段中间设计的一对引物,测试。
相信自己
5楼2014-03-31 12:46:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 大佬帮着分析今年的评审意见?该课题连续申请了三年了,明年要不要换个方向。 100+3 cai-11138 2026-08-31 11/550 2026-09-06 20:49 by archvillain
[文学芳草园] 两块石头 +7 阿美_Lml888 2026-09-03 10/500 2026-09-06 20:08 by 阿美_Lml888
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 19:21 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:41 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:21 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:01 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 17:21 by eObJPa4gWmp6
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 9/450 2026-09-06 17:09 by eObJPa4gWmp6
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 17:09 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才!!! +5 SCSIOyxguo 2026-09-03 8/400 2026-09-06 15:06 by 可爱小花朵
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 07:20 by E1iiBLMU2XnD
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 CRJ0Aq2FtVH0 2026-09-03 15/750 2026-09-06 05:48 by E1iiBLMU2XnD
[基金申请] 面上没中,邀请各位路过的虫友分析一下分数 +12 jackleilei 2026-09-03 13/650 2026-09-05 18:10 by fireguard
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[硕博家园] 哈尔滨工业大学韩晓军教授课题组招收2027年硕士推免生及博士研究生 +3 灯灯灯灯DDDD 2026-09-03 3/150 2026-09-03 21:22 by 科研皮皮猪
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
请填处理意见