| 查看: 1261 | 回复: 0 | |||
[求助]
用amber制作小分子力场时如何处理小分子的局部电荷和原子类型等参数
|
|
现在急需用amber制作一个小分子的charmm力场参数，费老大劲找到小分子的charmm力场下局部电荷和原子类型参数，但是按照教程中给的步骤进行制作过程，不知道怎么使用这些电荷和原子类型参数，哪位大神给帮忙指导一下，谢谢！参数如下所示 Group Atom Type Charge CH3 Head Group CT3 -0.395306 CH3 Head Group HC 0.123234 NO Head Group NO 0.740399 NO Head Group ON -0.692687 First CH2 Hydrophobic Tail CT2 -0.255242 First CH2 Hydrophobic Tail HC 0.065024 Second CH2 Hydrophobic Tail CT2 0.224586 Second CH2 Hydrophobic Tail HC 0.004149 |
回复此楼» 猜你喜欢
电气专硕320求调剂
已经有5人回复
-
一志愿西北工业大学289 085602
已经有33人回复
-
一志愿哈工大 085600 277 12材科基求调剂
已经有24人回复
-
268分085602化学工程调剂
已经有28人回复
-
化学工程调剂289
已经有50人回复
-
求调剂，262机械专硕
已经有8人回复
-
305求调剂
已经有6人回复
-
327求调剂
已经有5人回复
-
347求调剂
已经有4人回复
-
272分材料子求调剂
已经有47人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
蛋白受体中有 未知电荷的金属原子 如何计算其电荷数呢（AutoDock 自动给出的是0）
已经有5人回复
- 急求解答，关于力场的电荷参数！！！
已经有4人回复
- Amber 分子动力学 求助！！！！
已经有10人回复
- 使用amber力场，一些参数无法获得
已经有5人回复
- 高斯产生小分子参数问题
已经有6人回复
- 请问有没有小分子数据库可以直接下载相关的力场参数文件的？
已经有3人回复
- gromacs 添加新的力场pdb2gmx报错
已经有5人回复
- 用amber模拟γ-CD
已经有6人回复
- amber跑蛋白复合物动力学前，小分子用高斯如何处理
已经有7人回复
- gromacs oplsaa 力场中的原子类型
已经有6人回复
- ATP分子力场参数怎么做
已经有4人回复
- ds中的分子优化
已经有5人回复
- Amber tools 中的antechamber 必须要在安装了amber11的前体下才能使用么?
已经有4人回复
- 如何计算下面几个有机小分子的大小？
已经有9人回复
- gmx不认小分子PDB残基怎么办？？
已经有4人回复
- 分子力场的分类
已经有5人回复
- 【转帖】用Amber+Gaussian做小分子力场
已经有16人回复
- 【求助】在NAMD运行中使用CHARMM格式的力场文件，但力场参数来自AMBER力场，会出问题�
已经有4人回复
- 【求助】materials studio 软件中高分子材料模拟的力场选择
已经有10人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
