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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 用几种植物的某一基因的同源序列设计引物
汕头大学海洋科学接受调剂
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machao8405

木虫 (正式写手)

[求助] 用几种植物的某一基因的同源序列设计引物 已有2人参与

如题，有可能P出来未报道此基因植物的这条基因序列吗？
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1楼 2014-02-08 15:04:38
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-02-11 15:20:16
这几种植物同源性很高的话，保守区域设计引物可以扩出来，这就是同源克隆。
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hehe
2楼2014-02-09 09:16:37
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baihaer

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-02-11 15:20:20
如果基因同源性很高或者两端序列相对保守是可以P的，最好在P前和克隆后分别对该基因片段测通一下，比对以确定是否克隆成功。
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没有SB的事，只有SB的人
3楼2014-02-09 16:08:51
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machao8405

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by baihaer at 2014-02-09 16:08:51
如果基因同源性很高或者两端序列相对保守是可以P的，最好在P前和克隆后分别对该基因片段测通一下，比对以确定是否克隆成功。

为啥是基因两端相对保守？基因中间不会保守么？
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4楼2014-02-09 16:21:31
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baihaer

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-02-11 15:20:24
引用回帖:
4楼: Originally posted by machao8405 at 2014-02-09 16:21:31
为啥是基因两端相对保守？基因中间不会保守么？...

基因中间区域是否保守对于你克隆没有太大影响，目的基因片段两端的序列决定了你的引物设计。一般引物设计都是保护碱基+酶切位点序列+3/5端序列，所以如果你这个基因两端不保守而是可变的话，你怎么保证能够根据已知的同源基因P未报到的这个基因片段呢
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没有SB的事，只有SB的人
5楼2014-02-10 16:21:46
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machao8405

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by baihaer at 2014-02-10 16:21:46
基因中间区域是否保守对于你克隆没有太大影响，目的基因片段两端的序列决定了你的引物设计。一般引物设计都是保护碱基+酶切位点序列+3/5端序列，所以如果你这个基因两端不保守而是可变的话，你怎么保证能够根据已知 ...

我个人觉得两端同源性高的这种情况 应该不多 我想的是找到一段高度同源的片段 位置不限 这样能克隆出这个基因的一段序列 这样的几率可能相对大一些 如果想要全长 那就再做RACE 我是这么想的
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6楼2014-02-10 20:26:21
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baihaer

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by machao8405 at 2014-02-10 20:26:21
我个人觉得两端同源性高的这种情况 应该不多 我想的是找到一段高度同源的片段 位置不限 这样能克隆出这个基因的一段序列 这样的几率可能相对大一些 如果想要全长 那就再做RACE 我是这么想的...

也行，就具体你那个基因片段了。
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没有SB的事，只有SB的人
7楼2014-02-11 09:08:27
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