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求高手帮助,关于定点突变引物设计
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我想设计某个位点的定点突变引物,但是由于序列的GC含量很高,所以引物自身二聚体和发夹结构很多,自由能最高的为-6.8,我想请问有没有办法可以解决这个问题,因为序列无法变,所以真的没办法了 还有点突变的引物一定要在30个碱基左右么,Tm值真的太高了 请各位高手一定帮帮忙,万分感谢!!! 因为是第一次做这方面的,所以我想请问下,如果不用试剂盒,那么需要哪些试剂,步骤大概是什么? 之前看一些点突变试剂盒的说明书,要求不一样,所以如果我不用试剂盒那么引物的设计依据是怎样的呢? 点突变的 碱基位置均在上下游引物的中间么,还是一条在中间,另一条在最末端? 举个例子,之前看到过两种情况 1.cgagcagtagGtagcgatagtt 2. GCGGCTCGTG CCGCCGgCCGTCGCCGA gctcgtcatcCatcgctatcaa AGCCCGACCG CGCCGAGCAC GGCGGCc 到底哪种是可行的呢? 还有还有,很多都说Tm要大于78,这么高的退火温度可怎么进行延伸啊,能p成功么,还是说这是试剂盒要求的,不用试剂盒就不能使Tm过高? |
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