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muchun

铜虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
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帖子: 65
在线: 22.8小时
虫号: 766325
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专业: 植物生理与生化

[求助] 同源基因克隆已有2人参与

我有一段某种植物未知基因的序列，ncbi上只找到一个跟它蛋白有同源性的基因，假设这个基因是a，然后查到这个a基因编码的是b蛋白，然后搜b蛋白，查到了拟南芥这个b蛋白的功能，我现在想得到我上这个植物的这个基因的全长，但现在已知的序列跟拟南芥同源性很低怎么办，最后又怎么确定我得到的基因全长就是我这个植物里的b蛋白。不知我描述的是否清楚，急急急啊！！！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

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1楼 2014-01-02 00:09:32

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xiangchou812

木虫 (小有名气)

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专业: 微生物生态学

【答案】应助回帖

如果不是从拟南芥中扩这个基因而只是想得到所在植物中的基因全长，那直接做5‘RACE或3’RACE就行了。

3楼2014-01-12 21:40:24

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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

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专业: 植物生理与生化

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

同源性低，到底有多低呢？
既然已经有了部分序列，那就直接先用RACE的方法扩到全长，扩出全长后再比对核酸系列及蛋白序列。

2楼2014-01-02 00:30:20

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