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海之韵-哈哈

银虫 (小有名气)

[求助] native-page活性染色已有3人参与

最近在做native-page活性染色,蛋白为木聚糖酶,理论上染色脱色后目的条带处应为无色且为单一条带,胶的其余部分应为红色。但是我做出来的结果是从点样孔到胶的三分之一处是无色的,而不是一条单一的条带,感觉目的蛋白是边跑边反应。(跑胶时是在冰浴中进行的)请问有没有这种边跑边反应的可能性啊?如何避免这种情况?
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严以律已,宽以待人
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weishen2

银虫 (小有名气)

顶一下!我最近也打算做native-page,但是不知道从何入手,希望楼主传授下经验。
2楼2014-01-04 10:23:20
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lyt26802

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助! 2014-01-05 16:17:09
是不是酶的活性太大了 它走过的地方都显示成无色了
3楼2014-01-04 21:48:28
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海之韵-哈哈

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lyt26802 at 2014-01-04 21:48:28
是不是酶的活性太大了 它走过的地方都显示成无色了

如果是这样的话,是不是把酶液稀释了会好些啊?
严以律已,宽以待人
4楼2014-01-05 13:47:20
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

你的猜测和将要进行的处理方式都是正确的,就那样做吧。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
5楼2014-01-05 18:40:56
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海之韵-哈哈

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2014-01-05 18:40:56
你的猜测和将要进行的处理方式都是正确的,就那样做吧。

谢谢了,准备尝试一下
严以律已,宽以待人
6楼2014-01-06 09:23:17
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海之韵-哈哈

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2014-01-05 18:40:56
你的猜测和将要进行的处理方式都是正确的,就那样做吧。

试过了,还是跑不下来
严以律已,宽以待人
7楼2014-01-06 21:00:14
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

引用回帖:
7楼: Originally posted by 海之韵-哈哈 at 2014-01-06 21:00:14
试过了,还是跑不下来...

把你所有操作、试剂配方、结果都发上来,要多图,起码1千字。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2014-01-06 21:47:18
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海之韵-哈哈

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2014-01-06 21:47:18
把你所有操作、试剂配方、结果都发上来,要多图,起码1千字。...

Native-page:12%分离胶配方(10ml):水 2.4ml,30%丙烯酰胺 4ml,1.5M pH8.8 Tris-HCl 2.5ml,10% APS 0.1ml,TEMED 0.004ml,1%木聚糖溶液(pH8.0 Tris-HCl配制)1ml                                                                      5%浓缩胶配方(5ml):水 3.45ml,30%丙烯酰胺 0.83ml,1M pH6.8 Tris-HCl 0.63ml,10% APS 0.05ml,TEMED 0.005ml                                        5*Native-page上样buffer:1M pH6.8 Tris-HCl  1.25ml,溴酚蓝10mg,甘油2.5ml                                                                                                  刚果红染液:0.5g刚果红溶解到100ml 10%的乙醇中。
上样后80V50mA电泳至溴酚蓝前沿距胶1cm处,停止电泳。取出胶,浸泡在pH6.5柠檬酸-磷酸盐缓冲液(缓冲液是酶的最适反应缓冲液)中55度水浴30分钟,取出自来水冲洗两遍,加入刚果红染液染色30分钟,用1MNaCl溶液洗脱直至有清晰的条带出现。
电泳结果:1为原酶液,2酶液稀释10倍,3酶液稀释20倍,4酶液稀释50倍,5酶液稀释100倍
原酶液是由0.9%NaCl悬浮菌体超声波破碎后的上清液。
这次结果原酶液中跑出来一条带,但是跑不下来,溴酚蓝前沿已经跑到胶的最下面了。而且脱色后胶变成了黑色,以前用同样的方法染色脱色后胶布变黑,是红色的。
native-page活性染色


native-page活性染色-1
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严以律已,宽以待人
9楼2014-01-07 12:11:05
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weishen2

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我感觉这样的结果已经可以用了。如果楼主非要追求完美的话,楼主可以尝试多跑一段时间,或者把浓缩胶ph换成8.8,或者用10%的胶。
另外请教楼主native胶大概要跑多长时间,楼主蛋白的等电点是多少,蛋白是否有CBM结构域。因为我最近也在跑native胶,但是目的条带一直跑不出来。希望楼主给些参考!
10楼2014-01-07 18:41:52
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