| 查看: 1397 | 回复: 5 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
请问准备小分子配体时，有的准备不成功，是什么原因？已有1人参与
|
||
| 各位前辈，请问准备小分子配体时，有的准备不成功（结果显示0 pose），而有的成功了，是什么原因？ |
回复此楼» 猜你喜欢
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗
已经有8人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有5人回复
-
论文投稿，期刊推荐
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
-
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有14人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有5人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有3人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
基于小分子配体的药物设计---sybyl 纠结中......
已经有10人回复- sybyl , 无配体对接
已经有6人回复
- 如何将sybyl对接后的蛋白质和配体保存成一个PDB文件
已经有8人回复
- DMAEM水相ATRP反应，以bpy做配体不反应，原因？
已经有10人回复
- 分子对接时配体跟受体分开很远，配体不在受体活性口袋
已经有7人回复
- 分子对接前，含有配体的复合蛋白怎么处理？HETATM开头的元素要删除吗
已经有9人回复
- 有机配体分子量
已经有5人回复
- sybyl做分子对接，画的小分子对接不成功
已经有16人回复
- 油相合成的量子点配体交换不成功
已经有13人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- AMBER使用antechamber 准备配体小分子出问题，求指导方法，谢谢
已经有9人回复
- 蛋白分子建模 小分子化合物画图 酶与配体的分子模拟
已经有11人回复
- sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
已经有12人回复
- sybyl中的配体提取和准备问题
已经有7人回复
- 分子对接前配体是怎么处理的啊-例如用AD做
已经有14人回复
- 做分子对接前选择配体和受体时有什么要求吗？
已经有5人回复
- 求助：根据已知配体如何设计小分子配体
已经有3人回复
- 【求助】分子对接后如何计算配体小分子和受体蛋白质相应残基的平面角、面心距、点面距
已经有8人回复
monsoncupid
金虫 (小有名气)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 1629.9
- 红花: 3
- 帖子: 105
- 在线: 47.9小时
- 虫号: 2637881
- 注册: 2013-09-05
- 专业: 生物大分子结构与功能
5楼2014-01-02 21:12:06
monsoncupid
金虫 (小有名气)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 1629.9
- 红花: 3
- 帖子: 105
- 在线: 47.9小时
- 虫号: 2637881
- 注册: 2013-09-05
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wen530: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-12-25 22:41:11
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2013-12-31 16:19:35
感谢参与，应助指数 +1
wen530: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-12-25 22:41:11
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2013-12-31 16:19:35
|
你是说的prepare ligand 这步么？ 如果不需要如果你不想产生isomers和tautomers的话是没必要专门做prepare的，你只需要做一个geometry优化和minimization就可以了，至于失败的原因跟你参数设置有关系吧，你能说得详细点么 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
wen5302楼2013-12-25 17:18:55
3楼2013-12-25 22:55:43
4楼2013-12-28 17:15:17