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求助：根据已知配体如何设计小分子配体 已有3人参与
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本人正在做一个配体的类似物的设计与合成，已经有报道蛋白质和配体的三维结构图，我也已经分析出两者可能的作用位点。该蛋白的天然配体是一个三塘，合成比较困难，本人想根据天然配体与蛋白的结合位点和空间位置，设计配体的类似物，使其也能与蛋白结合，并且结构相对简单，最终想找到一个小分子化合物，能够有利于合成。 在这种情况下，我想到的是用计算机辅助药物设计的方法，但由于以前没有接触过类似的工作，不知道应该用什么软件来进行模拟？有没有软件能把我设计的化合物转变成三维结构，然后导入到PYMOL等软件中，可以分析它可能与蛋白的结合情况？或者与天然配体进行结构对照？ 或者有没有其它更好的方法？请大家多多指点，谢谢！ [ Last edited by bolix on 2011-1-13 at 21:53 ] |
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