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飘雪3889

木虫 (小有名气)

[求助] RT-PCR反应中模板DNA的问题 已有1人参与

我做RT-PCR,买的是Introvigen的试剂盒进行总RNA提取、逆转录成cDNA第一链、再PCR。以cDNA第一链作为模板进行PCR。今天有人指出,PCR是要用双链DNA为模板,而cDNA是单链,以单链为模板弄是错误的。而我看书上说RT-PCR是传统PCR的拓展,就是以cDNAA第一链作为模板的,合成第二链的过程实际已经包含在PCR过程中了,并且很多论文做RT-PCR的也是直接以cDNA第一链作为模板。请问下大家,我这样理解是不是对的?另外想到一个问题,以cDNA第一链作为模板进行PCR和以DNA双链为模板进行PCR,两种PCR试剂盒有没有区别,主要区别有哪些?谢谢大家了
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

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飘雪3889: 金币+10, ★★★很有帮助, 我前些天已经明白了,不过还是要感谢您 2013-12-24 16:28:23
以单链cDNA为模板做PCR没有问题,和双链DNA模板的区别是在反应第一个循环时,只有一条引物(与cDNA互补的那条)发生反应。第一个循环过后就生成了两条互补的DNA链,接下来的过程就是完全相同的了。做RT-PCR都是用单链cDNA直接P的。我不知道你说的PCR试剂盒是什么。反转率的试剂盒通常也只能合成第一条cDNA链,如果要获取双链cDNA,通常是把RNA模板消化掉后在进行PCR获得。通常用于PCR的盒子无外乎包括buffer, Mg2+, dNTP,酶,这些都是普通PCR反应所必需的,应该没有太大区别。如果要做荧光定量,还有荧光染料。
2楼2013-12-23 07:31:58
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