24小时热门版块排行榜    

查看: 7345  |  回复: 8

看天

木虫 (知名作家)

[求助] 多克隆酶切位点可以任意插入基因吗?不用考虑启动子的距离吗?

我金币多,重重有奖!!:
多克隆酶切位点可以任意插入基因吗?不用考虑启动子的距离吗?
如图的质粒,在MCS之前有个ptb启动子,用于其后基因的表达;我想问的是启动子后的MCS可以随意选择吗?不需要考虑启动子的距离或者其他序列吗?比如有的文献选用BamHI和AvaI作为外源基因插入位点;有的选择NdeI单酶切插入一个基因也能表达。从序列上看,NdeI位点插入的比BamHI/AvaI位点插入的距离启动子要多130bp呢?这样不经过任何修饰直接插入基因也能表达?

[ Last edited by 看天 on 2013-10-25 at 17:28 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生化实验经验积累 核酸方面

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)

戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
2楼2013-10-27 23:19:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)

来人给回答
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
3楼2013-10-28 13:44:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bleach060452

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
看天: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 我也经常听别人强调读码框要正确,请问还会有造成某个基因读码框混乱的情况吗? 2013-10-28 17:30:03
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 16:33:59
gyesang: 回帖置顶 2013-10-29 16:34:38
启动子和起始密码子是两回事,往往MCS中启动子到起始密码子(第一个氨基酸)中间会有一段距离(如表达载体,一般用来放置一些表达调控元件),对最终表达的目的蛋白是没影响的。

至于插入位置,需要考虑:排除目的基因中含有的的酶切位点与MCS中相同的酶;
                                    融合蛋白(载体提供,包括一些标签蛋白)是否需要,对目的蛋白是否有影响;
                                    最关键的一点,读码框要正确;
                                    然后还有一些理论外要考虑的,如酶是否常见好用、价格、是否有甲基化等麻烦等等~~
                                   通过这些的,理论上都能用,看你喜好怎么用了~~
P.S.:单酶切位点插目的基因时有一个麻烦,需要验证目的基因的“反正”,因为目的片段两侧是一样的粘性末端。
岂能尽如人意,但求无愧我心
4楼2013-10-28 14:42:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhouxiaofei

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
看天: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 是通过PCR的时候直接通过设计引物加入吗? 2013-10-28 17:31:03
gyesang: 金币+3, 鼓励交流! 2013-10-29 16:34:22
gyesang: 回帖置顶 2013-10-29 16:34:39
没有影响的,MCS的意思是你在里面任意位置插入基因片段都不会影响转录的。如果你要做启动表达,如果真核表达最好在ATG前加入GCCACC序列,kozak序列,帮助表达。
5楼2013-10-28 15:15:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bleach060452

新虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-10-29 16:34:30
一般确定上游的酶切位点和基因起始处的读码框正确,基本上就不会有问题了吧~~
岂能尽如人意,但求无愧我心
6楼2013-10-29 16:18:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by bleach060452 at 2013-10-29 16:18:24
一般确定上游的酶切位点和基因起始处的读码框正确,基本上就不会有问题了吧~~

如果我在一个基因里面插入一段外源序列,那么这个基因本身是失活了,但是它的转录还会继续进行吗,如果我要做RT-PCR,引物设计在插入位点之前,这个基因会不会还有表达被测出来?
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
7楼2013-11-01 22:47:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iayala

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 翻译不是只有从目的基因的ATG开始的吗?过克隆位点就已经开始翻译了? 2013-11-06 23:04:10
当然要考虑!但不是考虑启动子的位置,要考虑你用的酶切位点到你目的基因的ATG的距离是不是3的整倍数,如果不是,那就移码了,岂不是全乱了。
你要看的不是简单的质粒图谱,而是要看质粒文件中给的一段核算序列的标注。多克隆位点也是能够翻译出一段多肽的,你还不知道吗?不同的酶切位点到你目的基因的ATG的距离可不总是3的整数倍,有的错(开)1个,有的错2个,有的错3个,只有错3个的才行!
8楼2013-11-02 09:08:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bleach060452

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 看天 at 2013-11-01 22:47:01
如果我在一个基因里面插入一段外源序列,那么这个基因本身是失活了,但是它的转录还会继续进行吗,如果我要做RT-PCR,引物设计在插入位点之前,这个基因会不会还有表达被测出来?...

以我的理解应该是会的~~ 但是负责的说,我不确定,没这么做过。建议找个明白人问问,或者干脆找篇文献一看便知。
岂能尽如人意,但求无愧我心
9楼2013-11-04 10:08:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 看天 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 大佬帮着分析今年的评审意见?该课题连续申请了三年了,明年要不要换个方向。 100+3 cai-11138 2026-08-31 11/550 2026-09-06 20:49 by archvillain
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 19:21 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:41 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:21 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 17:21 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才!!! +5 SCSIOyxguo 2026-09-03 8/400 2026-09-06 15:06 by 可爱小花朵
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 13:09 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:29 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:20 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +10 瞬息宇宙 2026-09-01 19/950 2026-09-06 11:15 by jiangxuan2004
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 11:09 by eObJPa4gWmp6
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 CRJ0Aq2FtVH0 2026-09-03 15/750 2026-09-06 05:48 by E1iiBLMU2XnD
[基金申请] 面上没中,邀请各位路过的虫友分析一下分数 +12 jackleilei 2026-09-03 13/650 2026-09-05 18:10 by fireguard
[文学芳草园] 初秋的晨风 +4 阿美_Lml888 2026-09-04 6/300 2026-09-05 13:51 by 阿美_Lml888
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
请填处理意见