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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 一株霉菌的系统发育树构建
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可乐7红茶

银虫 (正式写手)

[求助] 一株霉菌的系统发育树构建

本人有一株分离出来的霉菌，已经鉴定过了，现在想构建系统发育树，软件已经会使用了，就是不知道该怎么选择构建发育树的模式菌株，BLAST出来的菌株相似性都太高了，基本都是99％或100％的，菌株都在一个树枝上，构建出来的树形不好看，想知道用什么网站或软件筛选同属不同种的模式菌株，求各位大神帮助！
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1楼 2013-10-21 16:30:13
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可乐7红茶

银虫 (正式写手)
2楼2013-10-23 14:47:37
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可乐7红茶

银虫 (正式写手)
3楼2013-10-24 10:00:28
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可乐7红茶

银虫 (正式写手)
4楼2013-11-26 19:34:30
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wairi

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你可以添加一些代表性的菌株加入发育树，比如酿酒酵母、黑曲霉、产黄青霉、橘青霉等。同时加入你BLAST出的模式菌株，再次构建系统发育树试试。
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5楼2013-11-29 09:38:09
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