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枫叶丹

新虫 (正式写手)

[求助] 怎么用mega比对不同长短的序列

我的序列长度差异太大,在mega中经过clustal W比对后仍有几条序列不一致,我有几条序列只有200bp而其他的都是1000多bp,怎么办
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枫叶丹

新虫 (正式写手)

这是上面问题的图片
怎么用mega比对不同长短的序列
ADE~8D$1C4M[QBQL]O@QE@S.jpg


怎么用mega比对不同长短的序列-1
H@TAR)I{B`L16(I@RX1OL1H.jpg

2楼2013-09-04 15:13:14
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erlei

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
枫叶丹: 金币+10, ★★★很有帮助, 看来还是要取齐,我明白怎么做了 2013-09-05 08:25:05
你要先确定你的序列对不对,如果是同一个基因的序列,相差一般不回如此悬殊;还有,序列比对最好要截取长度差不多的,clustal可以可以将序列取齐。参数方面没有什么问题,模型那块看你用什么了,一般是p-distance 或kimura2-parameter
3楼2013-09-05 08:14:34
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