24小时热门版块排行榜    

查看: 1850  |  回复: 5

行走的浪漫

新虫 (初入文坛)

[求助] MEGA 5.0建MP树

鄙人在用MEGA 5.0 建中药檀香的MP树,参数用的是临近互换算法,分支的支持率相当低,有的只有1,哪怕是同一个种的序列,已经用clustal x和bioedit 比对和校正过,因为不会用PAUP,还是想用MEGA,求赐教,在此先谢过各位大神。虽然金币少了点,希望有好心人救救我吧。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的序列是同样长短的吗?
不是很明白你所说的临近互换算法,英文是什么?
一般bootstrap值低的原因是序列相似度太高。
2楼2013-04-07 06:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小杨蓓

新虫 (小有名气)

3楼2013-04-07 13:00:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

行走的浪漫

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-04-07 06:58:09
你的序列是同样长短的吗?
不是很明白你所说的临近互换算法,英文是什么?
一般bootstrap值低的原因是序列相似度太高。

就是CNI,为什么是bootstrap值低是因为相似度太高?
4楼2013-04-07 22:42:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
行走的浪漫: 金币+3, ★★★很有帮助, 虽然还不是很明白,但还是先谢谢,因为我有几个很相似的序列聚在一起的时候只有1%或者2%,这我就不明白了 2013-04-08 20:30:33
引用回帖:
4楼: Originally posted by 行走的浪漫 at 2013-04-07 22:42:14
就是CNI,为什么是bootstrap值低是因为相似度太高?...

比如3个序列
AAAAA
AAAAT
AAATA
不考虑编码的话,序列1和2,3的进化距离是一样的,那bootstrap的值可以预计在50%左右
如果
AAAAA
AAAAT
AAATT
序列1和2更接近,那bootstrap value就可能高些
同理可推
5楼2013-04-08 05:56:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yitiandeng

木虫 (著名写手)

BP跟相似度有关系?
6楼2013-05-10 11:02:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 行走的浪漫 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-15 7/350 2026-03-16 09:43 by 闲人终南山
[考研] 材料专硕306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:19 by Demonsssss
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 调剂 +8 调剂的考研学生 2026-03-09 8/400 2026-03-15 22:14 by Winj1e
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 云南财经大学信息学院计算机学硕专硕学位点 +3 zjptai 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:23 by 飞行琦
[考研] 306求调剂 +4 唐薏薏 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:19 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
信息提示
请填处理意见